清华大学生命学院杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc,使用单细胞空间转录组数据构建细胞互作网络
DeepLinc针对单细胞空间转录组数据,提出新的方法理论,通过新型深度学习模型的创新应用,挖掘细胞分子特征谱图与复杂生理与病理组织之间的多层级复杂关联,充分释放单细胞空间组学分析的优势与潜力。
Nature Biotechnology :提出单细胞多组学数据整合与调控推断新方法
基因的转录在生物学中心法则中处于承上启下的重要环节,与相对“静态”的基因组相比,转录组在不同组织/器官/发育阶段均有显著变化,是细胞完成相应生理/病理功能的重要生物学基础。
Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录组及其发育轨迹特征分析研究获进展
Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中
直播来袭 | 单细胞功能蛋白质组学在肿瘤研究及治疗中的应用
IsoPlexis致力于提供业内广受赞誉的精准单细胞分析系统,助力加速对抗癌症及各种疑难病症的进程。通过揭示细胞亚群中独特的免疫生物标志物,推动免疫疗法及靶向治疗迈向更精准、个性化的发展阶段。
单细胞转录组学揭示了Shp2在myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的相反作用
myc驱动的肝脏肿瘤发生机制尚不清楚。该研究表明,在肝细胞特异性Ptpn11/ Shp2缺失的小鼠中,Mycdriven肝癌(HCC)显著加重。
单细胞转录组研究难治性多发性骨髓瘤亚克隆特异性微环境影响和药物反应
随着时间的推移,几乎所有的多发性骨髓瘤患者对治疗都会变得毫无反应。复发性/难治性多发性骨髓瘤(RRMM)伴随着骨髓瘤细胞的克隆性进化,并伴有异质性基因组畸变和骨髓微环境的深刻改变。然而,导致耐药性的分子机制仍然难以捉摸。
Nat Biotechnol:利用个性化磷蛋白组学揭示人体肌肉细胞中的哪些蛋白对增加运动后的糖吸收最为关键
在一项新的研究中,来自澳大利亚悉尼大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员开发出一种新的方法来确定我们细胞中的哪些蛋白对增加运动后的糖吸收最为关键---这是运动的一个重要好处,可以帮助维持良好的血糖水平。
Cell子刊: 人类诱导多能干细胞表观基因组异质性的内在基因组特性
人诱导多能干细胞(Human induced pluripotent stem cells, hiPSCs)因其表观异质性而表现出不同的分化潜能,除了印迹和X染色体等研究充分的成分/染色体外,其分化程度/属性尚不清楚。
Cell:新研究构建出人类基因组中的单细胞染色质图谱
在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员为人类基因组构建出单细胞染色质图谱。染色质是真核细胞中发现的由DNA和蛋白组成的复合物;在某些细胞核内,关键基因调控元件所在的染色质区域以开放的结构出现。在不同人类组织类型的细胞中精确地确定这些可访问的染色质区域将是理解基因调控元件(非编码DNA)在人类健康或疾病中的作用的重要一步。