空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型，用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Cell Discov | 上海交通大学范先群等合作通过单细胞测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构并增强了临床决策能力
本研究首次报道了CoM的组织结构和独特的TME，并通过将scRNA-seq数据整合到癌症治疗决策中提供了新颖的概念。
2024-06-21
Nature子刊：浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术，揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群
该研究利用MscT技术，通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略，揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。
2024-06-16
Nature：肝脏微环境的奥秘：Plexin B2如何成为肿瘤转移的“帮凶”
本研究结合转座子技术和荧光微环境标记，开发了一种体内CRISPR激活筛选方法，可系统地研究肝细胞和转移细胞之间的相互作用。
2024-09-07
Mol Psych：首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析
此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑，使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。
2024-08-14
Nature Methods：肿瘤微环境精准解析的新途径：CyLinter在多重成像中的应用
CyLinter的应用显著提升了高度多重组织成像数据的分析精度，为揭示复杂组织结构中的生物学机制，特别是在肿瘤微环境的研究中，提供了重要的技术支持和方法学创新。
2024-11-04
缺氧环境下细胞外囊泡中环状RNA转运之谜！Adv Sci (Weinh)：FUS蛋白在缺氧神经元中显著上调，促进circRNAs在sEVs中的选择性装载
该研究阐述了FUS如何选择性地促进circRNAs在缺氧神经元中的sEV装载，揭示了sEV介导的circRNA转运机制，并深化了我们对于细胞响应缺氧的理解。
2024-08-14
Nat Methods | 单细胞三维基因组与基因表达联合分析：北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程
该研究结果揭示了一个值得注意的模式：在OSN发展过程中，OR增强子的可及性降低，表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。
2024-04-17
J Med Virol：揭示HPV感染在人类头颈鳞状细胞癌微环境中所扮演的关键角色
本文研究增强了科学家们对于人类头颈鳞状细胞癌（HNSCC）微环境的理解，其或有望帮助指导HNSCC疗法的开发，尤其是在抑制癌细胞生长和迁移方面。
2024-03-08