Genome Biology:开发出单细胞基因组单分子测序新方法
单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB
J Crohns Colitis:从肠上皮细胞端粒角度治疗溃疡性结肠炎的新方法
溃疡性结肠炎(UC)是一种反复发作的结肠慢性炎症性疾病。在严重或长期病例中,肠上皮细胞端粒缩短已有报道。然而,其对UC发病机制的影响尚不清楚。为此,作者使用我们最初建立的长期器质性炎症模型来评估端粒缩短。本研究首次揭示了端粒缩短在UC发病机制中的作用。羟基积雪草苷(MD)可能是一种超越内镜黏膜愈合的UC治疗的新候选方法。图片来源:https://pubmed
Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合,可能会在哺乳动物胚胎发育过程中,通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象:一个受精
Science子刊:新型高通量无细胞无病毒定量中和测试方法可检测患者对SARS-CoV-2的免疫力,灵敏度高达96.7%
2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自瑞士洛桑大学医院和洛桑联邦理工学院的研究人员开发出一种新的高通量无细胞无病毒定量中和测试方法(high-throughput cell- and virus-free quantitative neutralization assay),其灵敏度足以测量血液中存在的SARS-CoV-2中和
Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱
水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控
Nat Commun:新方法富集造血干细胞,有望培育出更好的骨髓嵌合小鼠
2021年6月20日讯/生物谷BIOON/---为了研究人类健康和疾病中的免疫系统,科学家们通常使用经过基因操纵的小鼠造血干/祖细胞(hematopoietic stem and progenitor cell, HSPC)作为一个强大的模型系统。这些研究在与一些人类疾病的斗争中极具价值。然而,目前的实验方案是复杂的、耗时的和昂贵的。在一项新的研究中,来自日
Immunity:COVID-19人类脑组织分析揭示了神经炎症与小胶质细胞-T细胞的相互作用
SARS-CoV-2引起的COVID-19是一种会引起多器官并发症的严重疾病,其中主要并发症包括急性感染期间可能出现的神经症状(67%的患者),但也可能在治疗结束后出现。COVID-19的一个显著神经症状是丧失嗅觉,病情较轻者存在头痛、疲劳、记忆障碍、呕吐、步态障碍、呼吸困难和昏迷等症状,表明这些现象均涉及了几个大脑区域,如嗅球和延髓等。最新研究表明SARS
Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱
海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取,这在一定
Science:在单细胞分辨率下揭示SARS-CoV-2感染期间发生的T细胞反应
2021年5月31日讯/生物谷BIOON/---导致COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2正在全球肆虐。根据美国霍普金斯大学的最新统计数据(https://coronavirus.jhu.edu/map.html),超过1.69亿人遭受SARS-CoV-2感染。SARS-CoV-2对所有感染者的影响不尽相同。在一项新的研究中,来自瑞士、意大利和澳大利
科研人员开发出同时分析全基因组DNA甲基化与遗传变异的方法
中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneously from double strand bisul