单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature:中外科学家构建出迄今为止最全面的人类衰老骨骼肌的单细胞图谱
肌肉可以自我修复。这主要是由肌肉干细胞完成的,它们在受伤后开始增殖并分化成肌肉细胞,所产生的肌肉细胞相互融合或与现有肌纤维融合,以修复受损肌肉。
2024-04-28
Nat Biotechnol | 北京大学伊成器等团队合作开发同时对5mC和5hmC进行单细胞分析的新方法
该研究提出SIMPLE-seq(通过测序同时分析表观遗传胞嘧啶修饰),用于在单细胞和单碱基分辨率下联合分析5mC和5hmC。
2024-02-14
Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析
此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。
2024-08-14
同期两篇Cell论文,类器官+单细胞分析,揭示这种人类健康细胞实际是癌症“卧底”
这篇论文的第一作者 Maria Ramos Zapatero 博士表示,我们在这些结直肠癌中观察到的缓慢生长状态非常不寻常,通常只在胎儿发育或肠组织损伤后才会出现。
2023-12-12
Cell Discov | 上海交通大学范先群等合作通过单细胞测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构并增强了临床决策能力
本研究首次报道了CoM的组织结构和独特的TME,并通过将scRNA-seq数据整合到癌症治疗决策中提供了新颖的概念。
2024-06-21
Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群
该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。
2024-06-16
Cancer Cell:单细胞测序确定胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点
该研究对24个化疗前后的肿瘤组织进行了单细胞RNA测序,分析了神经母细胞瘤中的免疫调节相互作用,以确定优化免疫治疗效果的策略。
2024-01-15