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Genome Biol:新研究构建出单细胞多组学人类细胞百科全书

  1. 单细胞图谱
  2. 多组学
  3. 单细胞RNA测序

来源:生物谷原创 2024-05-23 14:12

这种新的单细胞图谱(SCA)是基于对来自125种不同成人和胎儿组织的数千份人体组织样本的分析。

在一项新的研究中,来自瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员开发了一种基于网络的平台,可以从细胞层面对人体进行全新的了解。他们的目的是为全世界的科学家们构建一个宝贵的资源,以增加有关人类健康和疾病的知识。相关研究结果近期发表在Genome Biology期刊上,论文标题为“Single Cell Atlas: a single-cell multi-omics human cell encyclopedia”。

同时测量众多生物分子变量(称为多组学)可对人类生物学进行深入全面的剖析。这种新的单细胞图谱(SCA)是基于对来自125种不同成人和胎儿组织的数千份人体组织样本的分析。这些作者将单细胞RNA测序、全基因组测序和空间转录组学等八项最先进的组学技术结合起来,对组织中表达的基因进行了绘图和定位。

为新发现铺平道路

这种平台提供了有关单个细胞特性及其在组织内相互作用的独特见解。大量数据可通过这种平台的网站(https://www.singlecellatlas.org/)免费访问。

论文第一作者、卡罗林斯卡医学院环境医学研究所研究员Lu Pan说,“这种单细胞图谱不仅节省了时间和资源,还为来自不同领域的科学家营造了合作环境,从而为新发现和创新铺平了道路。”

图片来自Genome Biology, 2024, doi:10.1186/s13059-024-03246-2

展望未来,这些作者计划通过引入更详细的分析和年度更新来完善这种单细胞图谱。这些改进将填补组织代表性方面的空白,并扩大样本量,从而进行更精确的研究。

科学界的宝贵资源

论文通讯作者、卡罗林斯卡医学院生理学与药理学系研究员Xuexin Li说,“这种单细胞图谱的构建标志着生物医学研究向前迈出了重要一步。我们的目标是不断丰富这种单细胞图谱的内容,使其成为了解人类健康和疾病的宝贵资源。”(生物谷Bioon.com)

参考资料:

Lu Pan et al. Single Cell Atlas: a single-cell multi-omics human cell encyclopedia. Genome Biology, 2024, doi:10.1186/s13059-024-03246-2.

Advanced cell atlas opens new doors in biomedical research
https://news.ki.se/advanced-cell-atlas-opens-new-doors-in-biomedical-research

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