揭示利用新开发的ExSeq测序技术高分辨率确定RNA在细胞中的位置
2021年1月29日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术,设计了一种方法,对组织样本中的信使RNA(mRNA)分子进行标记,然后对mRNA进行测序。相关研究结果发表在2021年1月29日的Science期刊上,论文标题为“Expansion sequencing: Spatially
我国科学家开发新技术,极大提高单细胞测序性能
单细胞全基因组测序(WGS)对于表征DNA中动态细胞间变化至关重要。当前用于单细胞WGS的样品制备技术复杂,昂贵,并且存在高扩增偏差和误差。厦门大学杨朝勇团队在Science Advances 在线发表题为“Digital-WGS: Automated, highly efficient whole-genome sequ
研究构建一个单细胞取样及小RNA检测的集成式单细胞电化学检测器件
细胞是生命结构和功能的基本单位,基于细胞的研究是生命研究的基础。为了揭示生命活动的规律,人们在不断的探索细胞的生长与分化、代谢与繁殖、运动与通讯、衰老与凋亡、遗传与进化等生命过程中的化学本质和规律。但是,由于细胞自身特性和研究手段的限制,当下生命科学研究通常以大量细胞为研究样本,然而基于大量细胞的实验结果难以反映单细胞水平上的生命活动
Nat Med:单细胞测序揭示胃癌患者差异化结局的原因
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员对来自腹膜癌(一种特定形式的转移性胃癌)患者的45,000多个细胞进行了分析,确定了广泛的细胞异质性,并确定了与患者生存相关的两种不同亚型。
研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Immunity:新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据
从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术,大大提高了从每个细胞收集的信息量。
Genome Med:单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法
2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性,这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源:CC0 Public Domain文章中,研究人员利用一种名为单细胞
单细胞测序找到背后原因
黑色素瘤是最为致命的皮肤癌类型,且发病率不低——根据美国癌症学会的统计,每38名白种人里,就有1人会在生命中的某一时刻罹患黑色素瘤。如果发现得早,这种恶性肿瘤还可以通过手术切除。一旦它发生扩散,治疗手段就会大受局限。但要早期发现黑色素瘤并非易事。在很多人的意识里,黑色素瘤来源于痣的恶化。然而事实上,这只能解释部分黑色素瘤的起源。大部分黑色素瘤在发
Cell Rep:单细胞测序预测化疗的有效性
在最近一项研究中,来自密歇根大学的Jun Hee Lee博士课题组使用一种单细胞RNA测序的技术,首次展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA损伤的基因表达差异。他们发现,这些反应可以被分为三类:激控制细胞死亡,细胞分裂或应激反应。相关结果发表在最近的《Cell Reports》杂志上。
NEJM:单细胞测序揭示线粒体疾病发生机制
在最近一项研究中,马萨诸塞州总医院(MGH)的人员在发现了有关一类线粒体疾病的新致病机制。线粒体疾病是一种遗传性疾病,会干扰体内能量的产生,目前尚无法治愈。该发现发表在《New England Journal of Medicine》上。