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bioRixv:单细胞分析和机器学习确定了COVID-19的主要靶点

2020年6月6日讯 /生物谷BIOON /——耶鲁大学医学院的科学家们正在利用单细胞RNA测序来研究SARS-CoV-2如何与宿主细胞相互作用。心血管医学和计算机科学部医学助理教授David van Dijk博士和实验室医学和免疫生物学助理教授Craig Wilen博士利用被感染的人类支气管上皮细胞(HBECs)的单细胞RNA序列数据来确定病毒如何感染和改

2020-06-06

Genome Biology :单细胞RNA测序可定量检测药物对胰岛细胞的效果

胰腺是产生消化酶以及调节血糖水平的激素的器官。胰岛专门负责激素的分泌,其中有β细胞和α细胞,β细胞会产生降低血液中葡萄糖水平所需的激素——胰岛素,而α细胞会产生负责升高血液中葡萄糖水平的激素——胰高血糖素。

2020-05-12

Nat Med:超急性期HIV-1感染多细胞免疫动力学的单细胞综合分析

2020年4月10日讯 /生物谷BIOON /——细胞免疫是控制细胞内病原体的关键,但在进化的人类免疫反应中,个体细胞动力学和细胞-细胞协同性仍然知之甚少。单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一个强有力的工具,可以用来分析健康和疾病中复杂的多细胞行为,并鉴定可测试的治疗靶点。将其应用于纵向样本可以提供一个揭示与疾病进展演变相关的细胞因子的机会,而不会潜在地混

2020-04-10

Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源:CC0 Public D

2020-04-09

稀有样本单细胞测序技术取得进展

近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch devic

2019-12-08

研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相

2019-11-16

研究人员通过单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

 2019年10月10日,来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次报道了由胎肝驱动的人胚胎造血和免疫系统发育过程的单细胞图谱。在该项研究中,作者首先制备了受孕后4周至17周的人胚胎肝

2019-11-07

《Cell》重磅:北京大学张泽民课题组与勃林格殷格翰联合发表关于单细胞测序刻画肝癌免疫微环境动态特征的研究

北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、生物医学前沿创新中心(BIOPIC)张泽民课题组、首都医科大学附属北京世纪坛医院彭吉润课题组以及德国药企勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim)公司肿瘤免疫与免疫调节部门多位科学家,在国际期刊Cell上发表了题为Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepat

2019-11-01

Science:利用单细胞基因组学进行人类细胞表型分析

2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中,瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中,我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所

2019-10-20

研究开发新型微滴反应筛选技术并开展单细胞分析应用

 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国专利,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。该系统和国外同类产品如美国Labc

2019-10-14