单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Cell Stem Cell:清华大学沈晓骅团队揭示核RNA稳态促进细胞命运和衰老的系统性协调
这些效应表明,核RNA的动态周转协调了基本过程之间的串扰,以优化细胞功能。核RNA稳态的破坏会导致系统性功能下降,改变细胞状态并促进衰老。
2024-04-19
Nat Methods | 单细胞三维基因组与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程
该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。
2024-04-17
Cell:揭示DHX9应激颗粒保护子细胞免受紫外线破坏的RNA的伤害
更好地了解新生成的子细胞如何选择性地识别和降解受损的RNA,可能为以RNA控制不善或应激反应失调为特征的疾病找到新的治疗靶点。
2024-04-02
Cancer Cell:单细胞测序确定胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点
该研究对24个化疗前后的肿瘤组织进行了单细胞RNA测序,分析了神经母细胞瘤中的免疫调节相互作用,以确定优化免疫治疗效果的策略。
2024-01-15