Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达
Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。
2024-07-15
Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制
该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。
2024-07-04
空间组学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析
此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。
2024-08-14
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10
JCI:唐晓芳等揭示内质网膜蛋白复合体调控肺表面活性蛋白C突变体SP-C(I73T)的转运并可作为间质性肺病的潜在治疗靶点
研究人员提出SFTPCI73T突变的主要致病机制:SP-C(I73T)突变蛋白在EMC3的参与调控下被错误地运输并累积在细胞膜处,从而破坏了AT2细胞内囊泡运输途径并造成线粒体功能障碍。
2024-11-07
多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展!
革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展
2024-04-30
Mechanobiol Med:机械约束或能引导胶质母细胞瘤癌症干细胞的空间模式
本文研究为阐明胶质母细胞瘤中爱这个干细胞独特空间模式的生物物理起源提供了新的见解,并为开发新型靶向性治疗策略提供了潜在的途径。
2024-04-13
Cell:新研究构建出肠道细胞的空间图谱,并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹
在以前的研究中,IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到,因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。
2024-04-22
Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。
2024-03-05