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应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

Cell:世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱发布

该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据,为后续的相关研究提供了重要的数据资源库,现已实现公开共享。 

2023-07-14

Nature:新研究在单细胞分辨率下绘制出人类肠道的空间图谱

当你想到自己理想中的社区时,也许你会想到绿树成荫的街道,或者一个紧密团结、互相帮助的社区。你很可能不会想到你的消化系统。

2023-07-25

Nat Biotechnol | 北京大学伊成器等团队合作开发同时对5mC和5hmC进行单细胞分析的新方法

该研究提出SIMPLE-seq(通过测序同时分析表观遗传胞嘧啶修饰),用于在单细胞和单碱基分辨率下联合分析5mC和5hmC。

2024-02-14

单细胞精度揭示苔藓类植物地钱的成熟和衰老轨迹

苔藓植物是植物界最原始的类群之一,它们生长在湿润和阴暗的环境中,没有根、茎和叶等器官,也不能通过维管束进行水分和养分的输送。尽管苔藓植物在进化上具有重要性,并且拥有相对简单的植株构造,但是人们对于其细

2023-06-17

刘琦/王平/何雅億团队提出AI计算解决方案,利用单细胞组学驱动泛癌肿瘤个体化组合用药

comboSC创新性的提出了一种单细胞组学驱动的泛癌种肿瘤个体化组合用药的计算框架和解决方案,在单细胞组学驱动的精准医学领域进行了有益的探索,其可行性和有效性经过了Proof-of-Concept验证

2023-12-06

研究人员开发出基于单分子测序平台的scNanoHi-C技术,可精准检测单细胞高阶染色质互作

真核生物基因的表达受到基因组中顺式作用元件的复杂调控。哺乳动物基因组中存在大量的顺式作用元件,例如:启动子、增强子、沉默子、绝缘子等等,其数量远远超过蛋白编码基因。

2023-09-18

科研人员发表关于单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用的综述文章

该文章介绍了多种前沿单细胞组学实验技术和空间组学实验技术并总结了常见的应用场景,剖析了这些新兴技术应用于肝脏样本可能产生的问题及潜在的实验或计算生物学解决方案。

2023-07-20

单细胞分辨率下揭示卵巢癌腹水对肿瘤原发灶及转移灶微环境的重塑作用

北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)张泽民教授团队与上海交通大学医学院附属新华医院汪希鹏教授团队,以及上海交通大学医学院上海市免疫学研究所博士后李子逸合作在

2023-08-21

Nature:科学家建立迄今为止最大规模肾脏多维单细胞图谱,能预测患者五年之后的肾功能状况

这是目前为止规模最大的人体肾脏单细胞研究,获得了迄今为止最全面的人体肾脏单细胞数据,建立了第一个人类肾脏的多维单细胞参考图谱。

2023-09-01