Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27
Nat Med揭示儿童肥胖的‘脂’命密码:脂质组学助力心脏代谢风险管理
本研究通过质谱分析对儿童和青少年的脂质谱进行分析,揭示了肥胖与多种脂质(如神经酰胺、磷脂酰乙醇胺等)的关联,并发现这些脂质与心脏代谢风险(如胰岛素抵抗、肝脂肪变性等)显著相关。
2024-09-23
科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库
该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。
2024-06-26
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16
Nature子刊:张翼/王行环团队开发精确测定单细胞年龄的时钟算法
该研究在ClockDML上发现了与有丝分裂相关的,细胞年龄依赖的染色体可及性,是一种良好的细胞年龄标记物,开发了用该标记物来追踪单细胞年龄的计算方法EpiTrace。
2024-05-13
Nature Cancer:张泽民/程斯进团队解析单细胞尺度下结直肠癌肿瘤微环境分型
该研究建立了一个高质量的人类肠道组织单细胞图谱,揭示了肿瘤特异性的细胞亚型和转录组变化,为解析结直肠癌的细胞和分子机制提供了新的见解。
2024-08-22
Cell:新研究表明靶向表达protogenin的癌症干细胞样细胞可让第3组髓母细胞瘤萎缩
消除Gr3-MB肿瘤中存在的少量干细胞样细胞,可使临床前模型中的肿瘤缩小。虽然还需要开展更多的研究,但这种新方法可能为治疗儿童Gr3-MB患者带来新途径。
2024-07-10
Nat Cancer | 张泽民/程斯进团队合作解析单细胞尺度下结直肠癌肿瘤微环境分型
该研究建立了一个高质量的人类肠道组织单细胞图谱,揭示了肿瘤特异性的细胞亚型和转录组变化,为解析结直肠癌的细胞和分子机制提供了新的见解。
2024-08-18
Sci Transl Med:科学家有望利用单细胞基因组学技术来加速人类肺部疾病药物的开发
来自德国的科学家们利用新型实验模型来研究肺部疾病,即所谓的人类精确切割肺部切片,这些是肺部组织的薄片,或能用于实验室的研究中。
2023-12-13