微滴式数字PCR检测血浆中非细胞游离Dna的EGFR突变
2013年作为PCR技术诞生30周年,在美丽的敦煌,2013第一届数字PCR前沿应用研讨会围绕PCR技术以及新一代的微滴式数字PCR在肿瘤标记分子领域的应用展开研讨,海内外知名的相关领域卓有建树的科学家采用大会报告以及专题讨论的形式,结合国际上转化医学研究的前沿动态与发展趋势,为大家带来一场生命科学的学术盛宴。
三个不同dPCR平台用于Dna拷贝数测量的比较研究
2013第一届数字PCR前沿应用研讨会于2013年8月20日(20日注册)~8月23日在敦煌(敦煌山庄)召开,2013年作为PCR技术诞生30周年,在美丽的敦煌,本次论坛将围绕PCR技术以及新一代的微滴式数字PCR在肿瘤标记分子领域的应用展开研讨,海内外知名的相关领域卓有建树的科学家采用大会报告以及专题讨论的形式,结合国际上转化医学研究的前沿动态与发展趋势,为大家带来一场生命科学的学术盛宴。
长非编码Rna与肿瘤
我们建立了一套筛选功能性ncRna的方法(Rna-SELEX-seq)。采用这种筛选方法,我们在人黑色素瘤细胞yusac细胞核中筛选得到5种可能与人PSF蛋白结合的功能性长ncRna
LincRna-p21调控糖酵解的机制研究
这里我们报道一个长片段非编码Rna lincRna-p21,它是一个被p53所转录调控的非编码Rna;我们发现它能响应低氧的刺激,并受Hif1α的转录调控。
miRna生物信息学及其在医学研究中的应用
miRna是一类重要的基因调控因子,越来越多的证据表明miRna在许多重要的生命过程中发挥着关键作用。因此,和miRna有关的功能异常和许多疾病有关(根据人类miRna疾病数据库, HMDD, http://cmbi.bjmu.edu.cn/hmdd, 的统计,目前已经有近400种人类疾病被报道了和miRna有关)。因此,miRna正在成为理解疾病发生发展机制的明星分子,并且疾病的预防、诊断与治疗中具有巨大的潜在的应用价值。从有关miRna研究的一开始,生物信息学在其中就发挥着重要作用。从miRna发现到靶基因预测,从分子进化到网络调控,从疾病易感位点确定到疾病miRna关联分析,都可以看到生物信息学的身影。在本报告中,报告人将重点介绍本人实验室在miRna-疾病-药物之间关系的生物信息学研究,从大规模数据分析到建模和预测,同时概括miRna生物信息学在医学研究中的应用。
全谱miRna非标记芯片技术
芯片技术是miRna表达谱高通量检测的主要手段之一,而常规芯片和测序技术常需要几小时的人工操作才能完成标记,导致成本过高、操作过于繁琐,重复性较差,因此,要走向临床比较困难。我们利用自主研发的技术,首次实现了高通量microRna芯片的非标记检测,大幅度降低了检测的标记时间和检测成本。 报告首先介绍了目前主流的miRna芯片技术,然后阐述了我们的芯片技术原理,并对性能进行了全面的评价和对比,除了无需对miRna进行标记以外,还具有以下优点:1,高效识别小分子Rna中间和末端的单碱基缺失、冗余的差异,常规芯片技术难以实现;2,高灵敏度,检测限为20 fM,检测丰度跨4个数量级,满足绝大多数小分子Rna的检测;3,直接使用总Rna,无需预分离小分子Rna,无需样品标记,大幅度降低了检测的时间和成本;4,检测不受植物等miRna的3'末端甲基化影响,而其他酶法标记的技术效率大幅度降低。 最后将我们的技术与测序技术进行了比较,认为我们的技术在检测成本、大量样品处理、数据分析、检测时间和重复性方面具有优势,是对比两种状态的miRna表达谱的一个理想技术。
高通量技术在非编码Rna领域中的应用
高通量技术指的是芯片、二代测序等能够帮助研究人员在短时候内进行全基因组范围内的快速筛选的技术,被广泛应用于基因组、转录组和表观遗传等方面。高通量技术在非编码Rna研究中的应用也十分广泛,不但可以筛选用于肿瘤诊断的miRna分子标记,还应用于miRna和lncRna的功能研究中。近年来出现的一些新技术,如链特异性测序(strand-specific Rna sequencing),降解组测序(Degradome sequencing ),Rna免疫共沉淀测序(Rna Immunoprecipitation Sequencing:RIP-Seq)等,以及一些新芯片与测序产品也为非编码Rna的研究提供了有力的工具。这里通过对一些应用案例的解析,讨论高通量技术在非编码Rna研究中的应用进展。
EZH2通过诱导异染色质形成来沉默 microRna-218的表达
陈扬超博士就胰腺癌高风险基因EZH2通过诱导异染色质形成来沉默microRna-218的表达的报告内容。
非编码Rna参与狼疮等自身免疫病的病理机制及临床意义
信号通路中的一些关键分子的表达或功能失调会导致细胞内信号通路紊乱从而参与疾病。非编码Rna(ncRna),包括miRna和长链非编码Rna(lncRna)在信号传递通路的调节中有着重要作用。我们以系统性红斑狼疮这一重要自身免疫疾病为研究模型来研究非编码Rna在自身免疫病关键致病通路中的作用。我们已发表的系列工作揭示了遗传及表观遗传因子可导致与狼疮重要免疫表型相关的一组miRna表达异常。我们也进一步多方位阐述了多个miRna分别或协同参与狼疮脏器受累相关的免疫炎症通路的异常活化的分子机制。更为重要的是,通过体外实验和体内研究证实了靶向干预疾病相关miRna可以改变疾病的异常免疫病理表型(nat Med 2012; PLoS Genet 2011; Blood 2010;J Immunol 2010; Arthritis Rheum 2009; 2010; 2011。受邀在nat Rev Rheumatol上发表特邀综述)。干扰素通路异常激活在系统性红斑狼疮的发病中起着重要作用。近期我们的研究发现lncRna能调节干扰素通路中的一个关键转录因子STAT1的表达从而参与STAT1信号传递通路的调节。这些研究为深入阐明ncRna在自身免疫性疾病发生发展中的细胞和分子机理,为今后发展ncRna靶向治疗提供理论基础。