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陈扬超:以微核糖核酸(microRna)为靶的抗癌药物研发

非编码微Rna(microRna)可通过调节众多基因的表达来行使致癌或是抑癌功能,调节microRna表达变化的小分子化合物被视为潜在的抗肿瘤药物。最近,在欧洲以微Rna(microRna-122)为靶的化合物作为抗丙肝病毒感染药物已经进入临床二期试验,标志着以非编码微Rna为靶的药物研发进入了一个新的时期。

非编码微Rna-34a(miR-34a)是一个肿瘤抑制基因,在包括肝癌在内的众多肿瘤中表达下调或是沉默。因此,miR-34a是一个很有前途的癌症治疗靶标。我们成功构建了一个miR-34a的荧光报告系统,通过该系统,我们从化合物文库中筛选出激活miR-34a表达的小分子化合物3。

化合物3可以特异激活肝癌细胞内miR-34a的表达及降低miR-34a目的基因的表达。 体内外试验证明化合物3具有明显的抗癌活性。比较化合物3与肝癌晚期用药Sorafenib显示化合物3具有更加显著的抗癌活性并且没有毒性。MiR-34a小分子调控剂作为潜在的新抗癌药物前景令人向望。

2015-05-15 课时:41分钟

Erich Gnaiger:Life Style and Mitochondrial Competence – Modern Drugs for T2 Diabetes in Aging and Degenerative Diseases.

D. Swarovski Research Laboratory (Mitochondrial Physiology), Dept. General, Visceral and Transplant Surgery, Innsbruck Medical University; and OROBOROS INSTRUMENTS, Innsbruck, Austria. - Email: erich.gnaiger@oroboros.at

The contribution of mitochondrial dysfunction to the etiology of T2 diabetes and a range of preventable metabolic diseases is the subject of intensive current research with world-wide health implications.

Recently these investigations gained depth and scope by technological advances for diagnosis of mitochondrial function by comprehensive OXPHOS analysis using high-resolution respirometry [1,2]. Fundamental questions of a causal relationship, however, between compromised mitochondrial function and development of T2 diabetes remain to be resolved [3,4] to optimize prevention and treatment of insulin resistance.

For preventable diseases such as T2 diabetes, the evolutionary background of mitochondrial competence provides a solid basis for improved and broad application of a well established modern drug, mtLSD.

Post-industrial societies are characterized by a high-energy input lifestyle with diminished physical activity and high incidence of non-transmittable diseases, in comparison to human populations where physical work is essentially important for sustaining life and in which degenerative diseases (T2 diabetes, various cancers, Alzheimer's) are essentially absent [5]. The capacity of oxidative phosphorylation (OXPHOS) is increased or maintained high by a life style involving endurance exercise and strength training [6].

Life style changes from the age of 20-30 years to the elderly, but is subject to change and intervention. Depending on group selection in cross-sectional studies, OXPHOS capacity declines from the age of 20-30 years [7,8], or is independent of age up to 80 years [9,10].

Independent of age, there is a strong decline of OXPHOS capacity in human vastus lateralis from BMI of 20 to 30 [1]. At a BMI >30, a threshold OXPHOS capacity is reached in human v. lateralis that may be characteristic of a low-grade inflammatory state (‘mitochondrial fever’).

Onset of degenerative diseases (T2 diabetes, neuromuscular degeneration, various cancers) and mitochondrial dysfunction interact in an amplification loop progressing slowly with age, such that cause and effect of mitochondrial dysfunction cannot be distinguished. Diminished antioxidant capacity at low mitochondrial density is an important mechanistic candidate in the state of mitochondrial fever.

For implementing a life style supporting mitochondrial competence and preventing degenerative diseases in modern societies, we need (1) extended research programmes focused on the causative link between mitochondrial competence and effective prevention of degenerative diseases, (2) educational programmes on mitochondrial physiology targeted at general practitioners, teachers and the society at large, (3) cooperation of health care and insurance organizations to support preventive life style activities, and (4) do not miss any opportunity in taking the lead in living the mtLife Style Drug (mtLSD).

2015-05-18 课时:47分钟

RiboZero和方向Rna库-陈巍学基因(15)

本节课程主要内容:
1.RiboZero与Poly(T)方法对比的技术优势
2.RiboZero的技术原理
3.建定向的Rna库的方法:
1)掺入U碱基的方法来标识cDna的第二条链
2)ScriptSeq方法

2015-06-01 课时:11分钟

MicroRna研究的综合解决方案

对于microRna的研究,已进行了十多年。基因芯片和新一代测序等高通量技术有力地推动了microRna的研究。李明辉博士在视频中先介绍了microRna的背景,概括了microRna研究的基本问题和研究方法。然后结合上海伯豪的服务内容,详细介绍了microRna研究的微阵列芯片和新一代测序方法,并辅以上海伯豪的多个具体技术服务案例进行详细说明。视频还对microRna的验证和功能研究方法进行了阐述。最后,结合实际案例,视频还介绍了如何将microRna作为生物标志物进行研究。

2015-07-09 课时:46分钟

nanoString--陈巍学基因(19)

本节课程向大家谈一下nanoString的分析方法。
从以下方面进行阐述:
nanoString的优点
nanoString的化学原理

2015-07-27 课时:9分钟

孙毅:Rna深度测序相关(TBD)

孙毅,博士,同济大学教授。美国加州大学洛杉矶分校终身教授,***“***” 国家***。长期致力与神经系统发育和疾病的表观遗传学及分子机制研究。在神经发育方面主要贡献在于阐明了神经干细胞或祖细胞在往神经元或胶质细胞分化过程中命运决定的分子机制,包括首次发现LIF 激动的JAK-STAT pathway 是星形胶质细胞命运决定的主要通路(co 1st author Science, 1997),首次阐明决定神经元命运的pro-neural bHLH 因子和JAK-STAT pathway 之间的相互抑制作用(1st author Cell, 2001)。

2001年孙毅教授在美国加州大学(UCLA) 建立实验室后潜心研究Dna 甲基化,组蛋白修饰,及非编码Rna 在神经系统发育,包括细胞命运决定,神经元功能成熟,及其可塑性变化过程中的作用。在神经疾病研究方面,她的实验室是最早开始用人类ES 细胞iPS 细胞做神经系统疾病模型的实验室之一,并取得了突破性成果。

2009年回国后,开始进行大量转化医学研究主要在干细胞治疗脊髓损伤方面开始了一系列原创性的研究。另外在用干细胞建立孤独症模型方面已取得突破性成果。她带领的团队在同济大学原创性地研发了体细胞单细胞全基因组转录本的Rna 深度测序方法并用于研究成体神经干细胞的分子生物学性状,探讨成体干细胞及肿瘤干细胞静息活化过程中的机制,该技术对未来寻找各类疾病包括衰老的分子标记会有划时代的推动。

2015-07-29 课时:45分钟

第一代Dna测序--陈巍学基因(25)

第一代Dna测序,是最经典的Dna测序方法。

本视频以BigDye试剂为主线,介绍了一代测序的三个最主要的技术:
Sanger先生发明的双脱氧(ddNTP)测序原理
BigDye的荧光标记方法
ABI 3500毛细管电泳分析原理

2015-10-08 课时:10分钟

上海伯豪lncRna芯片服务

上海伯豪针对广大客户的需求,开发出全新的lncRna芯片,并利用Agilent公司专利的SurePrint技术制造。为您提供完善的基因芯片技术服务,并完成数据分析,提供完整的实验报告。

SBC-lncRna芯片技术特点:
1)芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;
2)覆盖主流数据库几乎所有lncRna和mRna,可同时检测lncRna和mRna,并挖掘两者之间的关联;
3)随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRna
同时,上海伯豪利用Affymetrix开发的GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0 (HTA2.0)芯片,为客户提供常规mRna以及超过40,000个非编码转录本的表达检测服务,也是研究lncRna非常合适的技术手段。

2015-10-14 课时:7分钟

上海伯豪lncRna测序服务

转录组是特定物种、组织或细胞类型转录的所有Rna(转录本)的集合,包括mRna和非编码Rna(Non-coding Rna, 非编码Rna又包括:tRna,rRna,snoRna,microRna,piRna,lncRna等。通过比较转录组或基因表达谱的研究以揭示生物学现象或疾病发生的分子机制是高通量组学研究的一个常用策略。利用高通量测序技术研究转录组在全面快速得到基因表达谱变化的同时,还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的cSNP(编码序列单核苷酸多态性)、可变剪接等序列及结构变异,另外对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有其独特的优势。

转录组测序具有以下优势
1. 直接得到核酸序列信息,除了得到基因表达量的差异,更可以检测Rna的结构和结构变异。
2. 开放性的转录组分析:无需参考基因组信息,无需设计探针,不但能检测已知基因还能够发现新的转录本。
3. 在测序覆盖率足够大时能够检测到细胞中的低丰度转录本。
4. 随着测序深度的增加可以获得更广的动态检测范围,能够同时鉴定和定量高丰度转录本和低丰度转录本。

上海伯豪推出基于Illumina测序平台的全转录组测序服务,可同时检测样本中mRna和lncRna的表达,伯豪公司完善的实验管理体系和数据分析流程,为您研究lncRna提供全套解决方案。

2015-10-14 课时:8分钟

ACD Rnascope®原位定量技术在精准医疗研究中的应用

Rnascope®原位定量专利技术由美国新兴的分子病理领导者ACD公司(Advanced Cell Diagnostics, Inc., California, USA)开发,通过专利的双“Z”探针设计,使Rna原位杂交具有高度特异性、单分子检测的敏感性并有极高的信噪比,能够在单细胞水平同时定量多个Rna的表达,在获得单细胞中单拷贝Rna表达数据的同时提供完整的组织形态学信息,提高对疾病与标志物之间复杂的生物学相关性的认识,是理想的能够用于NGS和芯片技术后期转化研究技术平台。

自2011年技术推广以来,其应用已在如nature、Science、NEJM等国际顶级期刊发表超过300篇SCI论文。研究涵盖了感染及免疫、肿瘤、神经生物学、干细胞及发育、非编码Rna、表观遗传学等基础医学领域,以及靶标鉴别和验证、临床前安全性评价和药效评估等药物开发研究。

本课程详细介绍Rnascope®技术的基本原理,技术特点以及在肿瘤、非编码Rna、病毒及免疫等研究领域的应用实例。由于课程内容全英文,更多中文资料与信息请访问ACD中国官方微信号(ACD_China)或发送邮件info_china@acdbio.com咨询。

2016-12-23 课时:5分钟