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Nat Genet:颉伟/王海峰等报道小鼠胚胎失活X染色体高级结构从头建立过程及其调控机制

研究人员利用课题组开发的高灵敏sisHi-C技术,系统分析了从1-细胞胚胎到E9.5胚外组织以及E13.5胚胎细胞的X染色体三维结构,涵盖了X染色体印记失活和随机失活的建立和维持过程。

2024-09-15

科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱

该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。

2024-04-18

Science:细菌利用一种逆转录酶将非编码 RNA转化为新的基因,有效抑制病毒复制

Sternberg与Tang所研究的细菌防御系统显得异常独特:它涉及到一种未知功能的RNA片段以及一种逆转录酶——一种能够以RNA为模板合成DNA的酶。

2024-08-19

Cell Res:首个知识与数据联合驱动的多物种生命基础大模型GeneCompass,解析基因调控密码,打造干湿融合新范式

研究人员开发的GeneCompass模型参数量超过1.3亿,是国际上首个融入先验知识的预训练基础大模型,探索了知识与数据联合驱动的新范式。

2024-10-12

Sci Immuno :匡正团队发现环境因子通过HDAC3-TGFβ途径调控肠道簇细胞昼夜节律性分化调节肠道免疫

本研究通过探究HDAC3对肠道簇细胞的昼夜节律性分化增生的调控作用,揭示了表观遗传因子协同肠道菌群调控簇细胞的昼夜节律生成,以实时监测肠道环境变化以及维持肠道免疫稳态。

2024-10-09

Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno

在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。

2024-04-10

Mol Cell | 陈萍/李伟合作揭示FACT介导macroH2A清除机制及其在巨噬细胞功能调控中的作用

该研究全面揭示了组蛋白变体macroH2A通过S139关键位点调控分子伴侣FACT核小体维持功能的分子机制,并探讨这一机制在基因转录激活及巨噬细胞功能活化过程中的作用。

2024-08-12

Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

Nature Genetics:颉伟/王海峰团队等揭示小鼠胚胎失活X染色体高级结构从头建立过程及其调控机制

这一工作揭示了小鼠胚胎失活X染色体高级结构的从头建立过程,以及其潜在的基因调控功能。

2024-09-15

清华大学陈春来/刘俊杰团队揭示CasX靶标搜索和切割过程的动态调控机制

CasX独特的NTSB结构域在DNA解旋和R-loop形成中发挥了重要功能。这一动态模型深化了我们对CasX工作机制的理解,并为CasX以及其他Cas蛋白的优化和改造提出了新的思路和策略。

2024-07-15