Nature Communications: 不同肿瘤类型对PD-L1阻断反应的分子决定因素
靶向PD-1/PD-L1轴的免疫检查点抑制剂可在多个适应症的癌症患者亚群中产生持久的临床应答，包括非小细胞肺癌(NSCLC)、尿路上皮癌(UC)和肾细胞癌(RCC)。在此，作者对366例患者的PD-L1免疫组化(IHC)和肿瘤突变负担(TMB)与RNA-seq进行了补充，以确定统一的和适应症特异性的分子谱，这些分子谱可以预测这些肿瘤类型对检查点封锁的反应。多
NAR：科学家开发出一种能识别肿瘤和其微环境中特殊细胞类型的新型软件
2021年7月13日 讯 /生物谷BIOON/ --随着高通量基因组学检测变得更为有效且能产生一定的成本效益，使用该技术已经成为大规模生物医学研究计划的标准，这些研究通常是探索性的，因为样品之间的关联并不是之前已经明确的，而是从数据驱动的分子亚型的发现和注释中产生的，从而就为假设和独立性评估提供了一定的信息。在疾病、生物体和生物过程中发现新的群体或类别，并将
Frontiers of Medicine ：膜性肾病和其他类型肾病的比较分析和诊断模型的建立
中国人民解放军总医院肾脏病科朱晗玉和陈香美等在Frontiers of Medicine 发表研究论文《膜性肾病和其他类型肾病的比较分析和诊断模型的建立》（Comparative analysis of membranous and other nephropathy subtypes and establishment of a diagnostic mo
Signal Transduct Target Ther：激凝素1通过直接共激活NF-kappaBp65并增强其转录活性促进三阴性乳腺癌的生长
三阴性乳腺癌(TNBC)是乳腺癌中最具挑战性的亚型。人们在探索TNBC的分子生物学基础方面做了各种努力。在此，作者报道了激凝素1(KTN1)在TNBC中作为致癌启动子的新功能。KTN1在TNBC中的表达高于癌旁组织或腔内或Her2亚型，且KTN1高表达的TNBC患者预后较差。在功能研究中，KTN1基因的敲除抑制了TNBC在体内外的增殖和侵袭，而过表达KTN1
Nature发文：转录开关调控心脏成纤维细胞活化
越来越多研究表明，在许多人类疾病中，基因表达的动态变化助长了进行性的器官功能障碍。靶向基因转录已成为包括心力衰竭在内的各种慢性病的新治疗策略，其中BET蛋白的小分子抑制剂已经成为在体内可逆性的干扰增强子-启动子信号的有效工具，使用BET抑制剂可改善小鼠模型的心力衰竭，但具体机制尚不明确。近日，美国格莱斯顿研究所Deepak Sriva
Nature子刊：转录增强子控制鳞状细胞癌的癌干性和转移基因
肿瘤干细胞(Cancer stem cells, CSCs)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)侵袭性生长和转移中起着至关重要的作用。尽管在了解CSCs的自我更新和致瘤潜能方面已经取得了重大进展，但如何有效地消除CSCs和阻止转移仍然是一个关键的挑战。在这里，作者发现超级增强子(SEs)在癌症干细胞基因和前转移基因的转录中发挥了关键作用，从而控制了它们的致瘤潜能
Nature Communications：GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体
近日，国际知名期刊《Nature Communications》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院俞章盛团队的研究成果“GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profi
Science：利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合，可能会在哺乳动物胚胎发育过程中，通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象：一个受精
Genome Biology：揭示转录调节DNA复制起始的分子机制
DNA是主要的遗传物质，也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中，DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递，而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上，而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞，犹如独木桥上狮虎相遇，会发生什么呢？研究表明，DNA复制和转录在转录区域的相遇会产生大量的
摄入任何类型的咖啡或都与人群慢性肝病风险降低直接相关！
2021年6月26日 讯 /生物谷BIOON/ --慢性肝病（CLD）是世界范围内引发人群发病和死亡的一个日益增长的原因，尤其是在疾病负担较重且治疗手段非常有限的中低收入国家。咖啡的摄入与慢性肝病较低的发病率有关，但研究人员并不清楚不同类型的咖啡所产生的效应以及差异，因为不同类型的咖啡中的化学成分并不尽相同。近日，一篇发表在国际杂志BMC Public He