李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术，探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
科研人员开发表观转录组数据聚类框架iMVP
iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性，为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具，有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。
2023-10-13
Nature Genetics：清华大学刘念团队发现转座子LINE-1转录选择性激活远程基因表达
该研究提供了功能多样的LINE-1表达调控因子，发现并验证了LINE-1 5' UTR作为增强子在早期胚胎发育阶段通过转录依赖的方式直接与ZGA基因相互作用激活基因表达。
2024-06-11
Nat Biotechnol | RNA结构解析新纪元：一种全新的自动化、高效率的冷冻电镜图谱分析方法
该研究开发了一种基于深度学习的方法，从冷冻电镜图中自动构建全长全原子RNA结构，称为EMRNA。
2024-03-08
Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子
该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。
2024-03-12
Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27
Cell：焦建伟/董骥/杜鹏/靳蕾合作解析迄今最全人脑多区域时空发育图谱及规律
该研究将单细胞测序（scRNA-seq）和空间转录组技术（scStereo-seq）相结合，首次解析了迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm × 3cm）的人脑多区域时空发育转
2023-12-14
Cell子刊：李汉杰/陈昶/王光锁/陈云团队绘制早期肺腺癌免疫动态图谱，揭示Tfh细胞抗肿瘤机制
在这项研究中，为了阐明肺腺癌发展过程中的免疫动态和调节机制，研究团队对34个正常肺样本、4个浸润性原位腺癌、22个微浸润性腺癌等的免疫浸润进行了时间分辨单细胞RNA测序分析。
2024-03-11
Cell：清华大学李寅青/李丕龙团队揭示基因表达的“保温杯”——具有相分离能力双效应转录因子
这项研究揭示了一类具有相分离能力的dual-action TFs，它们通过选择性地招募转录核心组件，实现其独特的双效转录调节功能。
2024-04-21