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复旦邵志敏团队绘制迄今最大三阴性乳腺癌代谢组图谱

  三阴性乳腺癌(TNBC)的雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体2(HER2)均为阴性,大约占全部乳腺癌的15%。与激素受体阳性或HER2阳性乳腺癌相比,TNBC不仅恶性程度高、复发转移风险大,还缺少像内分泌治疗和抗HER2治疗这些积极有效的治疗手段[1]。因此亟需寻找TNBC中潜在有效的治疗靶点。2019年,来自复旦大学附属肿

2022-02-25

我国科学家描绘拟南芥芽再生染色质状态动态图谱

 未来作物设计发展迅速,但植物再生效率低逐渐成为该项技术的关键问题。在以往的研究中,植物芽的再生过程经历了转录水平的大规模重塑,然而生长素和细胞分裂素如何在染色质水平依次调控外植体(离体植物组织)体细胞的命运转变仍不清楚。近日,发表在《Developmental Cell》上的一项题为“Dynamic chromatin state profili

2022-02-21

Nat Commun:科学家揭示人类转录因子的调节机制

来自芬兰赫尔辛基大学等机构的科学家们进行了一项关于人类转录因子的新型大规模研究,该研究结合了两种最先进的交互组学技术,或能快速识别出蛋白质-蛋白质之间的相互作用,同时研究人员还提出了重要的基因家族的广泛功能信息。

2022-02-20

Nature:科学家绘制出炎症的行为性免疫图谱

  尽管利用单细胞转录组和蛋白质组学技术可以构建健康以及疾病组织的细胞景观图,但现在科学家还不能描述细胞不断改变的生化特性及其下游的动态情况。近日,西班牙国立心血管疾病研究中心在《Nature》发表了题为“Behavioural immune landscapes of inflammation”的文章。研究人员使用4D活体成像记录了几十

2022-02-14

"女娲"基因组计划第2篇:徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱

  可移动元件(也被称为转座子或转座元件)约占人类基因组的一半。在人类基因组中,Alu、LINE-1(L1)、SINE-VNTR-Alu(SVA)以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃的可移动元件家族,它们能够通过转座作用在基因组上形成新的插入,这种现象被称为可移动元件插入(Mobile Element Insertion,MEI)。转座事

2022-03-03

Nat Commun:科学家成功绘制出新型结肠基因图谱 或有望帮助阐明多种肠道疾病发生的分子机制

来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过利用空间转录组学技术分析了小鼠结肠中的基因表达,从而创建了一种能展示单个基因在组织中表达位置的图谱,当研究人员将此前已知的人类转录数据叠加到该图谱上时,研究人员就获得了对炎性肠病的新认识。

2022-02-21

Science:研究揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化过程中二价基因转录的功能

   中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作,在《科学》(Science)上,在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents the premature activation of bivalent genes during differentiation的研究论文,报道了CpG岛结合蛋

2022-02-15

“复旦肿瘤”科学家绘制出最大三阴性乳腺癌代谢物图谱

三阴性乳腺癌是“粉红杀手”乳腺癌的一种亚型,约占所有乳腺癌人群的15%。因恶性程度高、复发转移风险大、缺少精准治疗靶点,三阴性乳腺癌又被称为“最凶”乳腺癌。复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科邵志敏教授、江一舟教授领衔团队成功绘制出当前世界上最大规模的三阴性乳腺癌代谢物图谱,优化了既往分型标准,为三阴性乳腺癌的精准个体化治疗提供新方向;作为三阴性乳腺癌“复旦分型”研

2022-02-05

Human Genetics:基于机器学习建立人类遗传重组图谱取得进展

  中国科学院上海营养与健康研究所李海鹏研究组等在Human Genetics上,在线发表了题为Fine human genetic map based on UK10K data set的研究论文。遗传重组是生命进化的基础,在有性生物形成配子的过程中,来自父方和母方的染色体相互交换遗传物质,从而增加了相邻基因间不同等位基因的组合,丰富了

2022-01-26

我国科学家揭示活化转录因子4调控造血干细胞衰老的机制

  造血干细胞衰老与机体的衰老密切相关,但其机制仍不清楚。近日,南方医科大学的研究团队在《Science Advances》发表了题为“Loss of ATF4 leads to functional aging-like attrition of adult hematopoietic stem cells”的文章,认为活化转录因子4(

2022-01-28