Nature子刊:浙大团队揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛影响宿主细胞的生理和病理功能,并揭示了多种微环境细菌能够参与结直肠癌
Nature Communications:开发了基于转录调控因子的2-羟基戊二酸生物传感器
2-羟基戊二酸(2-Hydroxyglutarate,2-HG)是2-酮基戊二酸(2-Ketoglutarate,2-KG)的结构类似物,存在两种手性异构体L-2-HG和D-2-HG。2-HG可抑制多种2-KG依赖性双加氧酶、转氨酶的活性,通过抑制抑癌基因活性、改变细胞表观遗传水平等方式,引起恶性神经胶质瘤、急性髓细胞性白血病、肝内胆
Nature:新研究构建人类血脑屏障的分子图谱
在一项新的研究中,来自美国和德国多个研究机构的研究人员开发出一种方法来构建人类血脑屏障的分子图谱。相关研究结果于2022年2月14日在线发表在Nature期刊上。
Nucleic Acids Research:同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE
近些年,高通量单细胞测序技术的发展,使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性,但在实验过程中需要经历组织消化等操作,导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时,保留了细胞的空间信息,研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而,由于技术的限制,目前大多数空间转录组或是检
eLife:科学家发现向日葵调控紫外线模式的关键转录因子
花朵是植物繁殖的重要组成部分,花朵独特的颜色、形状和图案吸引了特定的花粉传播媒介,同时可以有助于保护植物免受捕食者和恶劣环境带来的不良影响。许多花朵含有吸收紫外线光 (UV) 的色素以显示不同紫外线图案,虽然人眼看不见,但大多数传粉者都能看到它们。例如,当在紫外线下观察时,向日葵的特征是“靶心”形状,中心暗周围有反射性外环,这种图案可以增加昆虫传播向日葵花粉
Nature子刊:发现Tcf1转录因子在T细胞免疫记忆和二次免疫应答中的重要调控作用
美国哈肯萨克大学医学中心 (Hackensack University Medical Center) 薛海晖教授团队和弗吉尼亚大学 (University of Virginia) 臧充之教授团队合作在《自然—免疫学》(Nature Immunology)上发表了题为“Tcf1 preprograms the mobilization of glycoly
复旦邵志敏团队绘制迄今最大三阴性乳腺癌代谢组图谱
三阴性乳腺癌(TNBC)的雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体2(HER2)均为阴性,大约占全部乳腺癌的15%。与激素受体阳性或HER2阳性乳腺癌相比,TNBC不仅恶性程度高、复发转移风险大,还缺少像内分泌治疗和抗HER2治疗这些积极有效的治疗手段[1]。因此亟需寻找TNBC中潜在有效的治疗靶点。2019年,来自复旦大学附属肿
我国科学家描绘拟南芥芽再生染色质状态动态图谱
未来作物设计发展迅速,但植物再生效率低逐渐成为该项技术的关键问题。在以往的研究中,植物芽的再生过程经历了转录水平的大规模重塑,然而生长素和细胞分裂素如何在染色质水平依次调控外植体(离体植物组织)体细胞的命运转变仍不清楚。近日,发表在《Developmental Cell》上的一项题为“Dynamic chromatin state profili
Nat Commun:科学家揭示人类转录因子的调节机制
来自芬兰赫尔辛基大学等机构的科学家们进行了一项关于人类转录因子的新型大规模研究,该研究结合了两种最先进的交互组学技术,或能快速识别出蛋白质-蛋白质之间的相互作用,同时研究人员还提出了重要的基因家族的广泛功能信息。
Nature:科学家绘制出炎症的行为性免疫图谱
尽管利用单细胞转录组和蛋白质组学技术可以构建健康以及疾病组织的细胞景观图,但现在科学家还不能描述细胞不断改变的生化特性及其下游的动态情况。近日,西班牙国立心血管疾病研究中心在《Nature》发表了题为“Behavioural immune landscapes of inflammation”的文章。研究人员使用4D活体成像记录了几十