Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。
Nat Chem Biol | 叶存奇课题组发现磷脂合成调节核苷酸代谢和细胞还原能力
这些发现强调了磷脂合成能够整合对核苷酸代谢、氧化还原平衡以及膜生物物理特性的调节能力,并以此在细胞防御中发挥关键作用。
Cell:从人体微生物组中挖掘全新抗菌肽,有望解决抗生素耐药性难题
该研究利用计算和实验筛选平台,挖掘了一个最近扩展的微生物组微型蛋白数据库,以寻找具有抗菌活性的候选抗菌肽,并鉴定了高效和特异的抗菌肽序列。
科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库
该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。
细菌能够在基因组外从头生成新基因,以对抗病毒感染
这项颠覆性研究表明,DRT2系统执行了一种前所未有的免疫防御机制,该机制涉及通过非编码RNA(ncRNA)的滚环逆转录来指导DNA的从头合成,并通过程序化模板跳跃产生串联的cDNA重复序列。
David Baker最新Science论文:AI从头设计蛋白,用作生物传感器
,这项发表于 Science 的研究展示了通过深度学习模型来设计基于假环肽的、具有模块化重复结构和中央结合口袋的小分子结合蛋白,对靶标小分子化合物具有高结合亲和力,并可以实现下游传感。
Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术
在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。
Cell Host & Microbe:功能失调的线粒体或会破坏肠道微生物组,从而引起克罗恩病的发生
本文研究结果表明,上皮组织中的线粒体功能扰乱或会引发具有炎性肠病相关的特异性炎性基因图谱的微生物群依赖性损伤。
Front Pharmacol:肠道微生态与代谢组学研究发现褪黑素或成糖尿病认知障碍治疗新希望
研究表明褪黑素可改善糖尿病小鼠认知功能,减轻海马病理变化和炎症,调节肠道微生物群组成及代谢物谱,恢复短链脂肪酸水平,提示其通过调节肠道微生态和代谢组学改善糖尿病认知障碍。
Nature:科学家成功结合人工智能技术和连接组的潜能来预测大脑细胞的活性
本文研究中,研究人员提出了一种新型策略,该策略能揭示了一种能从链接性测量中产生关于神经回路功能机制的详细假设。