揭示Rho让RNA聚合酶失活终止转录新机制
2020年11月29日讯/生物谷BIOON/---基因表达分为转录阶段和翻译阶段。科学家们之前一直并不知道在细胞中,DNA转录一旦开始,是如何被正确关闭的。在转录过程中,一种称为RNA聚合酶的酶将自身包裹在DNA的双螺旋周围,使用一条DNA链与核苷酸匹配以形成遗传物质的副本---一条新合成的RNA链,该RNA链的合成在转录完成后会释放出来。所产生的RNA可以
纳米孔PromethION测序+Shasta完成人类基因组端粒到着丝粒的高效从头组装
Shasta是一个用于纳米孔测序数据的从头组装和矫正算法,由加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)和陈-扎克伯格倡议计划(CZI)联合开发。团队在2019年利用初代Shasta分析流程对纳米孔测序数据进行从头组装、矫正和Hi-C拼接Scaffold(图1),使用一台纳米孔PromethION测序设备在9天内完成了11个人类基因组测序,研究成果发表在《N
利用纳米孔测序研究人体组织样本等位基因效应对转录组结构的影响
不同的组织和个体之间的基因表达和调控的差异很大,大部分的常见复杂性状相关的基因组通过假定表达和剪接机制来发挥作用,如10%的致病突变都具有已知的剪接效应,RNA测序则能够很好的分析等位基因特异性并解读遗传变异。迄今为止的大多数RNA测序研究都使用短读长RNA测序技术;由于短读长容易出现多重定位的情况,因此很难确定异构体的来源,同时会给定量带来干扰
Cell:我国科学家揭示新冠病毒复制转录复合体的低温电镜结构
2020年11月17日讯/生物谷BIOON/---SARS-CoV-2 mRNA的转录需要由复制转录复合体(replication and transcription complex, RTC)促进的一系列反应。在一项新的研究中,来自中国清华大学、上海科技大学和武汉大学的研究人员展示了SARS-CoV-2 RTC向cap结构合成过渡时的结构快照。他们解析出由
研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Science子刊:转录因子STAT5持续激活可提高CAR-T细胞的抗肿瘤免疫反应
2020年11月6日讯/生物谷BIOON/---使用嵌合抗原受体(CAR)T细胞(CAR-T)的过继性细胞疗法显示出强大的抗肿瘤免疫力,但T细胞衰竭可能损害它们的疗效。多功能性CD4+ T细胞的存在通常与良好的抗肿瘤免疫力有关。科学家们之前发现IL-7处理可诱导产生多种细胞因子的多功能性CD4+ T细胞激活。在一项新的研究中,来自美国奥古斯塔大学等研究机构的
多篇文章聚焦科学家们在转录因子研究上取得的新成果!
本文中,小编整理了科学家们近年来在转录因子领域研究上取得的新进展,分享给大家!图片来源:Maria Schumacher, Duke University【1】Nature解读!细胞中转录因子与错配DNA强烈结合的分子机制!doi:10.1038/s41586-020-2843-2日前,一篇发表在国际杂志Nature上题为“DNA Mismatches Re
细胞中转录因子与错配DNA强烈结合的分子机制!
2020年10月26日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一篇发表在国际杂志Nature上题为“DNA Mismatches Reveal Conformational Penalties in Protein-DNA Recognition”的研究报告中,来自杜克大学等机构的科学家们通过研究发现,转录因子可能会无意中锁定DNA中所发生的错误。转录因子蛋白
研究揭示抗铝毒转录因子STOP1的SUMO化调控机制
10月21日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zinc Finger Transcription Fac
研究揭示天然反义转录本调控microRNA生物合成和植物抗热性机制
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上,发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and attenuate plant thermotoler