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Cell Res:首个知识与数据联合驱动的多物种生命基础大模型GeneCompass,解析基因调控密码,打造干湿融合新范式

研究人员开发的GeneCompass模型参数量超过1.3亿,是国际上首个融入先验知识的预训练基础大模型,探索了知识与数据联合驱动的新范式。

2024-10-12

上海交大洪亮团队开发扩散概率模型——CPDiffusion,设计生成高活性的人工内切核酸酶

CPDiffusion作为一种强大的全新蛋白质序列设计工具,为生物学家和蛋白质工程设计者提供了全新的可能性,用于设计功能更强大的蛋白质、研究蛋白质功能的逐渐演化过程、丰富现有蛋白质的数据库等。

2024-09-14

Nature子刊:陈斯迪团队开发多种Cas12a 敲入小鼠模型,用于多重基因组编辑、疾病建模和免疫细胞工程

在这项最新研究中,陈斯迪教授团队开发了一系列背景为 C57BL/6 的 Cre 依赖的条件性表达小鼠或组成性表达 Cas12a 小鼠模型,包括 LbCas12a 和高保真增强版 AsCas12a。

2025-03-25

Cell Metab | 婴幼儿代谢生长和遗传疾病的预测模型

该研究介绍了婴儿-WBMs,这是一种考虑性别特异性和器官差异的婴儿代谢模型资源,可预测婴儿出生后0至6个月的生长情况,并能准确预测IMDs中血液生物标志物的变化,为新生儿和婴儿代谢研究提供了重要资源。

2024-07-12

bioRxiv:科学家开发出遗传定义的类器官模型,有望揭示驱动鳞状细胞肿瘤进化的机制并识别潜在的疗法脆弱性

本文研究揭示了UASCC早期进化背后的关键驱动因素和分子程序,并建立了遗传定义的类器官模型来作为发现机制和治疗手段的有价值强大工具。

2025-02-14

Immunity | 王毅全/吕惠彬等开发记忆B细胞语言模型用于抗体特异性预测

研究团队开发了记忆B细胞语言模型(mBLM),使其学习功能性抗体的内在“语法”,并进一步区分血凝素(HA)头部和茎部抗体以及针对其他抗原的抗体。

2024-08-22

Nat Method:单细胞分辨率下对细胞信号交流进行分析的多实例学习模型-Spacia

Spacia模型能够帮助研究者从各种生物学样品的单细胞空间转录组数据中获得新的知识。

2024-09-06

Int J Mol Sci:科学家利用人类诱导多能干细胞开发出新型神经类器官模型,或有望评估机体的发育性神经毒性

本文研究中,研究人员所开发出的新型神经类器官模型表现出了与此前研究中使用鱼藤酮类似的敏感性水平,从而就进一步验证了这种新型3D类器官模型的实用性和潜能。

2025-01-13

J Hazard Mater:人脑类器官等多种模型证实香茅醇可穿透血脑屏障并激活毒性代谢通路致神经损伤

香茅醇在斑马鱼、小鼠、脑芯片系统和人脑类器官等模型中可穿透血脑屏障,通过激活犬尿氨酸代谢途径、引发氧化应激和神经炎症等多途径诱导神经毒性,导致斑马鱼行为异常,凸显其在消费品中潜在风险及监管必要性。

2025-01-06

周昌阳/杨辉/熊志奇/黄行许团队开发新型表观遗传编辑工具,有效缓解天使综合征小鼠模型症状

在该研究中,研究团队通过在天使综合征(AS)小鼠模型中引入这一表观遗传编辑系统,成功实现了UBE3A基因的重新激活。

2024-09-22