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结构域边界插入来调节基因组的空间折叠

 北京时间2020年8月31日晚23时,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学医学院的Gerd Blobel教授,其实验室的张帝(Di Zhang),和他们的合作者在Nature Genetics上发表了题为Alteration of genome folding via contact domain boundary insertion的论文,报道了通

2020-09-03

地钱中TCP家族转录因子活性与染色质三维构象变化相关

  基因组学的研究不应止步于从基因组序列或表观遗传修饰中获得信息,深入挖掘三维染色质折叠对于了解基因组功能同样至关重要。近十年来,高通量测序技术的进步和高分辨率成像技术的发展使得基因组复杂的三维结构组织形式日益清晰的呈现在人们眼前。其中,利用Hi-C(high-throughput chromosome conformation capt

2020-09-11

《细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

 顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术,能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出,染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构,无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此,研究人员

2020-08-22

Cell:深度突变扫描揭示新冠病毒S蛋白受体结合结构域突变对S蛋白折叠和结合ACE2的影响

2020年8月18日讯/生物谷BIOON/---随着新型冠状病毒的传播,它又出现了新的突变--不管是好是坏。如今,在一项新的研究中,美国霍华德-休斯医学研究所研究员Jesse Bloom和他的同事们已经将近4000种不同的突变如何改变了SARS-CoV-2与人类细胞结合的能力进行了编目。他们的数据以交互式地图的形式在网上公开,是科学家们开发抗病毒药物和疫苗以

2020-08-18

研究揭示染色质重塑因子Smarca5促进胚胎期造血干祖细胞发育

 造血作用可以产生所有类型的血细胞,包括红细胞、血小板、巨噬细胞和淋巴细胞等。这些血细胞来源于具有自我更新和多向分化潜能的造血干祖细胞(hematopoietic stem and progenitor cells,HSPCs)。脊椎动物中,最早的新生造血干祖细胞,是由主动脉-性腺-中肾区(aorta-gonad-mesonephros,AGM)的

2020-08-11

Science:我国科学家发现人中和抗体结合SARS-CoV-2刺突蛋白的N端结构域

2020年6月25日讯/生物谷BIOON/---COVID-19在全球范围内的爆发已成为对人类健康的严重威胁。COVID-19是由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的。这种病毒是一种正链包膜RNA病毒,可引起人类咳嗽、头痛、呼吸困难、肌痛、发热和严重肺炎等症状。SARS-CoV-2是β冠状病毒属的成员,分别在2002年和2012年引起流行病的SARS-Co

2020-06-25

研究发现RIPK3蛋白RHIM结构域调控细胞死亡和炎症的新机制

 5月19日,国际学术期刊Cell Reports 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所章海兵课题组的研究论文“Crucial roles of the RIP homotypic interaction motifs (RHIM) of RIPK3 in RIPK1-dependent cell death and lymphoprolife

2020-05-22

研究发现节律性调控染色质重塑和脂代谢基因表达的分子开关

5月4日,国际学术期刊Nature Metabolism 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所丁秋蓉课题组的研究论文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。该研究发现MRG15作为一个进化上保守的表观调控因子在调控肝

2020-05-08

Oncotarget:研究揭示染色质暴露程度对于人类癌症的发生与发展的影响

在最近一项研究中,作者分析了404位癌症患者的ATAC-seq数据,并将染色质的分子特性与患者的人口统计学,肿瘤组织学,分子亚型和生存率之间建立了联系。

2020-05-07

土传病原真菌染色质重塑抵御寄主ROS胁迫研究获进展

 近日,中国科学院微生物研究所研究员郭惠珊在PLOS PATHOGENS 在线发表了题为Verticillium dahliae chromatin remodeling facilitates the DNA damage repair in response to plant ROS stress 的研究论文,发现了土传病原真菌通过染色质重塑应

2020-04-24