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Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术

MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。

2024-09-13

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

Nat Commun:通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应

这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。

2024-12-27

Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术

通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。

2024-07-16

Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术

在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。

2024-10-04

Nature Nanotechnology:类器官中形态发生素的空间-时间控制:纳米DNA微珠开启精准生物工程新时代

该研究展示了DNA微珠技术在类器官中的广泛应用潜力,为类器官内复杂信号通路的研究提供了新的可能性。

2024-09-11

Nature:首次构建出人类胸腺细胞空间图谱,揭示人体免疫反应如何在生命早期建立和维持

这项研究的一项重要成果是开发了一种名为OrganAxis的标准化高分辨率空间绘图方法,用于比较胸腺样本在不同发育阶段的组成和结构组织,其分辨率比以往任何时候都要高得多。

2024-11-26

Nature:科学家利用空间蛋白质组学技术开发出治疗人类中毒性表皮坏死的新疗法

本文研究揭示了JAK/STAT和干扰素信号通路或能作为驱动中毒性表皮坏死发生的关键致病性驱动因素,并阐明了靶向性JAK抑制剂作为一种新型治疗性手段的巨大潜力。

2024-10-24