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Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展!

革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展

2024-04-30

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-04

Cell Rep:识别出能控制黑色素瘤改变形状对环境产生反应的特殊基因 有望帮助开发新型靶向性疗法

本文研究结果表明,为了响应3D几何学和机械线索所发生癌细胞形状的改变或许能以环境依赖性和独立性的方式进行调节。

2024-04-24

Cell:新研究构建出肠道细胞的空间图谱,并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹

在以前的研究中,IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到,因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。

2024-04-22

Nature Cell Biology:跨区机械力协调细胞形状和命运转变,生成组织结构

研究团队以小鼠毛囊胎盘为范例,构建并从遗传学角度验证了上皮片转化为胎盘芽的生物力学模型

2024-02-26

哈佛团队分析近900万死者数据发现,出租车和救护车司机因阿尔茨海默病死亡风险全职业最低,或与空间导航能力有关

研究者猜测,工作中对空间和导航能力的频繁需求或许加强了出租车司机和救护车司机的海马体,这赋予了他们对阿尔茨海默病(AD)的抵抗力。

2024-12-25

Nature:科学家揭秘中性粒细胞细胞核神秘形状形成背后的分子机制

本文研究结果表明,在中性粒细胞祖细胞中,环状挤压程序能产生谱系特异性的染色质架构,从而允许染色体包装成为在几何上受限的小叶结构。

2024-02-23

Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析

随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。

2024-03-05

空间组学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14