科研人员绘制出肝内胆管癌的多组学分子特征全景
肝内胆管癌（intrahepatic cholangiocarcinoma，iCCA）是原发性肝恶性肿瘤，当前手术切除率低，并缺乏有效的靶向/免疫治疗方案。肝内胆管癌具有高度异质性的基因组突变和肿瘤微环境，可能介导其高侵袭性和不良预后。因此，迫切需要对iCCA进行“鸟瞰式”研究，绘制其精确的分子图谱，为系统理解肝内胆管癌异质性及实现个体化治疗提供理论依据。中
多组学数据资源体系建设取得系列进展
在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）出版的2022年度数据库专刊上，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）共有10篇论文集中发布，包括1篇整体介绍和9篇数据库论文，展示了国家生物信息中心多组学数据资源体系建设的最新成果。2021年，国家基因组科学数据中心与共建单位及30多家合作单位
Nat Genet：对2658份肿瘤样本进行分析揭示引起癌症的新型突变
来自Francis Crick研究所等机构的科学家们通过研究发现，21%的肿瘤都携带有双重突变，即你机体的DNA在母本和副本中都有完全相同的碱基发生了突变，这是此前在分析肿瘤时并未考虑到的观察结果，但对于未来癌症研究却非常重要，因为在癌症发生过程中，研究人员能够阐明突变的起源以及生物学意义。
周虎/樊嘉/高强/高大明团队绘制肝内胆管癌的多组学分子特征全景
肝内胆管癌（intrahepatic cholangiocarcinoma，iCCA）是第二常见的原发性肝恶性肿瘤，当前手术切除率低，同时缺乏有效的靶向/免疫治疗方案。肝内胆管癌具有高度异质性的基因组突变和肿瘤微环境，可能介导其高侵袭性和不良预后。因此，迫切需要对iCCA进行“鸟瞰式”研究，绘制其精确的分子图谱，为系统理解肝内胆管癌异
Nat Commun：全面的多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病的不同致病性过程
2021年12月31日 讯 /生物谷BIOON/ --如今科学家们对慢性淋巴细胞白血病（CLL，chronic lymphocytic leukemia）的基因组图谱理解地越来越详细，这或许就对积累信息的背景提供了一定的挑战。近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Multi-platform profiling chara
Cancer Cell：樊嘉/周虎等绘制肝内胆管癌多组学分子特征全景
肝内胆管癌（iCCA）是第二常见的原发性肝恶性肿瘤，当前手术切除率低，同时缺乏有效的靶向/免疫治疗方案。肝内胆管癌具有高度异质性的基因组突变和肿瘤微环境，可能介导其高侵袭性和不良预后。因此，迫切需要对iCCA进行“鸟瞰式”研究，绘制其精确的分子图谱，为系统理解肝内胆管癌异质性及实现个体化治疗提供理论依据。复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中科院上海药物所周虎研究
科研人员提出新方法评估典范分析中解释变量的相对重要性
典范分析（canonical analysis）是生态学多元统计的核心分析方法，主要用于量化环境因子（解释变量）对多物种生物群落（响应变量）的决定作用。由于涉及参数较多，典范分析中的对具有多重共线性的解释变量的相对重要性评估是个尚未解决的难题。以往的分析使用简单效应（simple effect）、边际效应（marginal effec
Molecular Cancer: 单细胞RNA-seq分析发现一种非编码RNA介导肝癌对索拉非尼治疗的耐药性
索拉非尼是一种多激酶抑制剂，是fda批准的一线药物，用于治疗不能切除的肝细胞癌(Hcc)。不幸的是，这些患者的治疗效果微乎其微，总体生存期仅提高了3个月。在初步应答后，大多数肝癌患者出现抗药性和疾病进展。