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CRISPR筛查数据的综合分析为优化癌症免疫治疗发现了新的机遇

  1. 癌症

来源:本站原创 2022-01-19 20:20

近年来,功能性遗传免疫肿瘤学筛查的应用显示了识别参与肿瘤免疫相互作用的潜在调节因子的惊人能力。

近年来,功能性遗传免疫肿瘤学筛查的应用显示了识别参与肿瘤免疫相互作用的潜在调节因子的惊人能力。虽然这些筛选已经产生了大量的数据,但很少有研究试图系统地汇总和分析这些数据。在这项研究中,对肿瘤免疫相关功能筛查进行了全面的数据收集。利用大规模基因组数据集进行综合分析。


图片来源: https://doi.org/10.1186/s12943-021-01462-z

MON2是一种蛋白质编码基因,已被证实参与调节内体到高尔基体的运输。到目前为止,MON2与免疫生态系统之间的关系在很大程度上仍不清楚。结果表明,MON2功能丧失与ICBS的反应率提高有关,揭示了该基因与肿瘤免疫相关的新作用。

根据作者的发现,抑制MON2可能是一种潜在的治疗策略,具有增强免疫诱导的肿瘤杀伤力的能力。值得注意的是,目前大多数免疫肿瘤学药物的靶点,如PD-L1CTLA-4LAG-3TIM-3,都表达在细胞表面,并能直接介导肿瘤与免疫的相互作用。然而,从概念上讲,MON2与免疫相关功能没有直接联系,因此很难解释它作为免疫肿瘤学靶点的作用。

ICB治疗患者选择的预测生物标志物的开发一直是目前研究的重点。在过去的几年中,研究人员已经确定了多种具有预测潜力的生物标志物,包括肿瘤突变负荷(TMB)MSI状态、PD-1/PD-L1基因表达、CD8+T细胞丰度等。其中,TMB是研究最多的生物标志物TMB-HIGH被认为是ICB治疗跨癌症的高应答率的通用指标。然而,最近的一项研究发现,对于cd8细胞丰度与新抗原呈正相关的癌症类型,tmb只应被认为是icb治疗的有效生物标志物

免疫疗法与其他疗法,如化疗和靶向治疗相结合,可能比单一用药更能增强杀瘤效果。由于只有一些特定的组合表现出协同效应,设计联合用药方案的关键一步是确定合适的联合候选方案。通过硅的方法,已经做出了一些努力来辨别潜在的免疫治疗组合。

在本研究中,作者提出了一种改进的基于签名匹配的计算方法,它是多种已有方法的集成。这一方法确定了代表癌症免疫治疗药物协同作用的可能性的分数。值得注意的是,排名前十的药物中有四种,包括伊立替康、槲皮素、氟尿嘧啶和白藜芦醇,已经被证明具有免疫调节功能。

伊立替康是一种广泛用于治疗多种癌症的化疗药物。已有报道伊立替康通过调节肿瘤微环境激活抗肿瘤免疫,通过上调MHC-I类基因表达增强肿瘤免疫原性,从而与抗PD-L1治疗有协同作用。槲皮素被广泛认为是一种抗氧化的黄酮类化合物。


提高免疫治疗疗效的潜在免疫调节剂的鉴定

图片来源: https://doi.org/10.1186/s12943-021-01462-z

总之,通过利用广泛的筛查数据以及来自TCGAICB治疗队列的分子和临床数据,这项研究确定了一种新的免疫治疗靶点、一个预测性标记和几种免疫治疗组合的候选药物。重要的是,本研究加深了我们对肿瘤免疫的认识,为今后肿瘤免疫治疗的研究提供了基础。(生物谷 Bioon.com

参考文献

Yan Li et al. Integrative analysis of CRISPR screening data uncovers new opportunities for optimizing cancer immunotherapy. Mol Cancer. 2022 Jan 2;21(1):2. doi: 10.1186/s12943-021-01462-z.

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