Nature Methods:解锁细胞宇宙的“星图”——scvi-hub如何将海量单细胞数据“浓缩”到你的笔记本电脑里?
如果说单细胞数据是浩瀚的宇宙,那么细胞图谱就是我们绘制的星图。scvi-hub所做的,就是将这幅无比庞大、复杂的星图,转化为一个轻便、智能、人人可用的“数字天文馆”。
Nature Genetics:陈万泽团队开发单细胞转录因子测序技术,剖析转录因子剂量对细胞重编程异质性的影响
该研究开发了 scTF-seq技术,实现了剂量敏感的大规模基因扰动单细胞组学,并以转录因子介导的细胞重编程为模型,系统揭示了基因剂量在细胞命运调控中未被充分认识的多层次、非线性复杂效应。
Biomed Pharmacother:多模态单细胞技术助力药物筛选新发现
本研究构建携带囊性纤维化跨膜传导调节因子-S308X无义突变的患者特异性诱导多能干细胞气道类器官,结合多模态单细胞技术,揭示疾病炎症机制,筛选出氯沙坦等潜在药物,为相关囊性纤维化治疗提供新方向。
Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录组平台
Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。
Nat Cell Biol:人体造血干细胞的代谢图谱,科学家解锁血液疾病治疗的新钥匙
本文研究通过分析机体中造血干祖细胞的代谢、脂质和转录组特征,揭示了其在分化、衰老和AML发生过程中的代谢变化,并发现胆碱在维持造血干祖细胞功能中的潜在作用。
Cancer Cell:黄活聪团队通过单细胞空间分析,揭示抗原呈递癌症相关成纤维细胞的“双重身份”及其空间生态位
该研究通过单细胞分辨率空间分析,揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAF)包含了两个截然不同的亚群——间皮样 apCAF(M-apCAF),另一种是纤维细胞样 apCAF(F-apCAF)。
【5月14日直播预告】单细胞多组学技术解锁肿瘤微环境研究前沿研讨会
从基因组学、转录组学到蛋白质组学、代谢组学等,从以组织为单位的测序到以单细胞为单位的单细胞测序;从无空间信息的组学技术到空间组学技术,再到空间单细胞组学技术。肿瘤精准诊疗已经从单一层次的基因变异研究快
Nat Genet:科学家成功绘制出新型细胞图谱,有望揭示神经母细胞瘤肿瘤微环境的显著改变
研究人员们发现,神经母细胞瘤细胞在治疗过程中会发生显著的变化,一些细胞变得更加成熟,其能呈现出类似神经元的特征,而另一些细胞则变得更加活跃,其增殖能力更强且代谢也更加旺盛。
Nature Genetics:告别“批量”模糊——首个大规模单细胞研究,解码胶质母细胞瘤纵向演变的“个体差异”与“普遍规律”
这项研究的发现具有重要的临床意义。它提示我们,GBM复发是一个高度个体化的过程。理解每个患者肿瘤独特的演变轨迹以及驱动这一轨迹的关键因素,是实现精准治疗的关键。