Cell系列综述:刘光慧团队在单细胞水平上概述代谢衰老的异质性
该综述详尽地概述了代谢衰老在组织和细胞异质性上的特征,并分析了这些异质性对干预措施的反应。同时深入剖析了衰老过程中关键代谢途径的脆弱性,并评估了在不同器官和细胞类型中代谢衰老干预策略的效能。
2024-10-07
Cell Discov | 上海交通大学范先群等合作通过单细胞测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构并增强了临床决策能力
本研究首次报道了CoM的组织结构和独特的TME,并通过将scRNA-seq数据整合到癌症治疗决策中提供了新颖的概念。
2024-06-21
Nature Genetics:单细胞视角下的肿瘤增殖密码——SPRINTER精准解析克隆异质性的新工具
该方法不仅揭示了克隆间增殖率的显著异质性,还关联了高增殖克隆与癌症转移潜力、循环肿瘤DNA(ctDNA)释放等临床重要特征。
2024-12-08
Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因
这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。
2024-10-03
Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法
结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。
2024-10-02
Dev Cell :范衡宇实验室揭示RNA解旋酶MTR4介导的RNA监管机制决定小鼠卵母细胞体积增长的机制
这一系列研究揭示了卵母细胞生长过程中的mRNA转录后加工调控和监管对于建立卵母细胞发育潜能的重要作用,为解析卵母细胞如何生长成为体内最大的细胞提供了新的理论。
2024-10-13
Nat Commun:新研究揭示RNA竟还能帮助细胞修复DNA双链断裂修复
Storici团队发现,RNA可以根据它与断裂DNA链的互补性,影响使用哪种工具。这意味着,RNA 除了是重要的蛋白生产信使外,在 DNA 修复方面还扮演着工头和工人的双重角色。
2024-12-07
Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27