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Cell | 隐翅虫“生化武器”进化的基因组学与细胞基础

研究人员通过基因组组装、比较基因组学、进化树构建、细胞特异性转录组学等方法对隐翅虫的防御性腺体的分泌特征以及进化特征进行了刻画,并对隐翅虫与蚁类共生体这一高复杂性的分泌特征进行检测。

2024-07-18

CGM:我国科学家探究TP53基因缺失如何驱动胃癌进化

随着胃癌病情的发展,特定基因的改变,包括基因拷贝数的变化和结构变异,会以相对明确但并非随机的顺序发生,这对癌症充分发挥其恶性潜能至关重要。

2024-05-20

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-27

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

共同奏响“病理诊断最强音”!商汤医疗联合行业顶尖专家发布国内首个病理大模型

此次发布的病理大模型PathOrchestra,将视觉模型和大语言模型结合,利用国内规模最大的近30万张全切片数字病理图像(近300TB数据)数据集训练,并融合了文本、视频等多模态训练数据。

2024-07-07

Nat Eco Evo | 吴法柏/Bernheim团队揭示从古菌到真核的免疫蛋白进化

Viperin(干扰素诱导内质网关联病毒抑制蛋白)是人类先天免疫系统的成员,直接参与到病毒防御中。

2024-07-16

GUT:科学家首次发现,早老素缺失或是AD和肠炎的共同病因!

研究首次揭示了早老素Psen1和Psen2在肠道稳态中的关键作用,可以通过影响肠上皮细胞分化平衡来维持屏障完整性,避免营养不良和肠道炎症的发展。

2024-05-16

二球悬铃木古六倍体基因组进化及开花调节方面取得重要进展

研究结果表明二球悬铃木开花时间基因的拷贝数增加及随后的亚功能化/新功能化可能为二球悬铃木独特的开花特征提供了遗传基础。

2024-06-13

Gut:上海交大/浙大团队共同揭示“点燃”胰腺癌免疫微环境的表观遗传治疗靶点!

在本次研究中,研究者们进行了专门的CRISPR-Cas9表观遗传体外筛选,结果显示,仅有敲除胰腺癌细胞的Med12,会在小鼠实验中显著影响成瘤速度和免疫微环境。

2024-09-06

Nat Biotechnol:科学家通过利用新型算法分析肿瘤的遗传组成 有望准确测定癌症的进化机制

文章中,研究人员详细了一种新型在线资源,其或能帮助科学家们选择最佳的算法进行肿瘤进化的分析,同时还能增强对肿瘤的诊断准确性和疗法计划。

2024-06-21