全基因组选择软件--GVCBLUP 2.1发布
2月21日,明尼苏达州大学杨达教授发布了GVCBLUP 2.1软件,该软件主要应用于基因组选择领域,能有效地利用全基因组的单核苷酸多态标记预测基因组育种值,并估计遗传变异的加性及显性效应。
Nat Cell Biol:全基因组解析人类细胞的分泌过程
在细胞中,不同的基因都处于沉默状态(中间和底部),相比正常细胞(最上面),特殊位点的分泌过程开始进行(绿色代表开始分泌) (Credit: Image courtesy of UCD Conway Institute of Biomolecular & Biomedical Research) 近日,爱尔兰都柏林大学和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究者共同努力...
Comms:梅花基因组测序
对于梅花(Prunus mume),中国人寄托了太多的情感,这一早在三千多年前就已经被驯化的植物光是诗词绝句,就可以上万来计算,更别说“梅须逊雪三分白,雪却输梅一段香”这样的名家名句了。12月27日Nature Communications杂志公布了由北京林业大学,深圳华大基因等处完成的梅花基因组测序成果,这是蔷薇科梅花亚科中首个完成的基因组序列。
PBJ:花生转录组de novo测序揭示果针发育相关的功能基因
近日,由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士,山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology Journal。该杂志创刊于2003年,影响因子5.44,是专注于应用植物科学的期刊。
BMC:构建易变山羊草首个转录组数据库
易变山羊草(2n=4x=28, UUSvSv, Ae. variabilis syn. Triticum peregrinum (Hack In J. Fraser) Marie & Hackel)是小麦的近缘物种,与小麦进行远源杂交时可产生可育后代,是小麦育种改良的重要资源。
Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序
2012年11月23日 讯 /生物谷BIOON/ --人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。 该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋白质组,并描述了所有表达的蛋白质。
:世界首次公开和破译双峰驼全基因组序列图谱
11月13日,中国科学院上海生命科学研究院/中国科学院系统生物学重点实验室李亦学研究员课题组与内蒙古农业大学、上海交通大学、南开大学等研究机构的科研人员合作完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作,成果在Nature子刊Nature Communications上在线发表,这项工作的生物信息学分析部分的主要研究骨干是系统生物学重点实验室的丁国徽副研究员,王振博士后以及李圣迪研究生等。
Nat Genet:伯基特淋巴瘤全基因组测序揭示基因突变遗传图谱
2012年11月14日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,来自杜克大学医学院的研究者在对伯基特淋巴瘤(Burkitt lymphoma tumor)的基因图谱绘制过程中,鉴别出了70个基因突变,包括未报道的和癌症相关的突变以及和疾病发病相关的一个特殊的基因。相关研究刊登于11月11日的国际杂志Nature Genetis上,为研究者开发新型药物或者疗法提供了很大帮助。
Sci Transl Med:对人类胎儿的整个基因组测序
近日,刊登在国际著名杂志Science Translational Medicine上的一篇文章中,研究人员指出,他们已经用从一名孕妇及一个即将成为父亲的人身上获取的DNA样本重构了一个人类胎儿的全部基因组序列。 这些发现开启了用一种非侵入性测试来对某胎儿的所有单基因疾病或“孟德尔”病进行产前评估的可能性,而这种测试可替换像羊膜穿刺术及绒毛膜取样等侵入性的手术。