纳米孔PromethION测序+Shasta完成人类基因组端粒到着丝粒的高效从头组装
Shasta是一个用于纳米孔测序数据的从头组装和矫正算法,由加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)和陈-扎克伯格倡议计划(CZI)联合开发。团队在2019年利用初代Shasta分析流程对纳米孔测序数据进行从头组装、矫正和Hi-C拼接Scaffold(图1),使用一台纳米孔PromethION测序设备在9天内完成了11个人类基因组测序,研究成果发表在《N
两篇Science论文成功设计发育信号,有望为再生医学指明方向
2020年10月20日讯/生物谷BIOON/---一个微小的胚胎要想发育成一个成年的有机体,它的细胞必须以精确的模式发育,并以精心安排的方式与周围的细胞相互作用。为了构建复杂的组织和器官,所有这些发育中的细胞都必须不断地回答一个基本的、但令人惊讶的困难问题:我在哪里?美国加州大学旧金山分校分子与细胞药理学系主任Wendell Lim博士说,“在再生医学领域,
香港科大设计出世界首个3D人工眼球,比人眼看得更远更清楚
好消息是,由香港科技大学(HKUST)科学家领导的国际团队开发出了世界上首款3D人工眼,这款‘电化学仿生眼’,首次复制了人眼的曲面结构,为视觉类人机器人和视力障碍患者带来了新希望。令人好奇的是,人造眼球真的能让盲人像正常人一样看清世界吗?它又是怎样工作的呢?这一切,还要从眼球的结构说起。不是所有的人工眼,都能让人看清世界要了解人工眼,先要了解真正眼球的结构。
大肠杆菌新型宽范围木糖生物传感器的设计和优化方面取得新进展
近日,国际合成生物学领域权威期刊《ACS Synthetic Biology》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院赵心清教授与美国德克萨斯大学奥斯汀分校Hal Alper教授的合作研究成果“Design, evolution, and characterization of a xylose biosensor in Escherichia coli us
罗氏达成18亿美元合作 利用人工智能设计新一代AAV载体
Dyno Therapeutics今天宣布与罗氏(Roche)达成一项合作和许可协议,将利用该公司的CapsidMap平台开发新一代腺相关病毒(AAV)载体,用于为罗氏和旗下Spark Therapeutics公司的研发管线开发治疗中枢神经系统(CNS)疾病的基因疗法和肝脏定向递送的疗法。目前的基因疗法主要局限于使用少数天然存在的AAV载体,这些
西湖大学联合团队《自然》发文:首次实现跨膜孔蛋白的精确从头设计
北京时间8月26日23时,Nature杂志在线发表西湖大学生命科学学院卢培龙研究员课题组与华盛顿大学David Baker等课题组合作的人工设计跨膜蛋白质的最新研究:《跨膜孔蛋白的计算机辅助设计》(Computational Design of Transmembrane Pores)。该研究在世界上首次实现了跨膜孔蛋白的精确从头设计。华盛顿大学
利用模块化合成重新设计现有的抗生素分子
2020年9月29日讯/生物谷BIOON/---抗生素耐药性是世界上最紧迫的公共卫生威胁之一。仅在美国,每年就有数万人死于金黄色葡萄球菌和粪肠球菌等常见细菌的耐药性菌株,这些菌株可导致几乎无法治疗的医院感染。目前很少有新型抗生素被开发出来用于对抗已经对传统抗生素产生耐药性的感染,而将任何一种新药推向市场可能需要几十年时间。如今,在一项新的研究中,来自美国加州
Science:计算机设计的小蛋白可高效抑制新冠病毒感染
2020年9月19日讯/生物谷BIOON/---SARS-CoV-2是导致新冠肺炎(COVID-19)的冠状病毒。在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学和乔治亚大学的研究人员发现计算机设计的小蛋白(miniprotein)可以保护实验室培养的人细胞免受SARS-CoV-2感染。相关研究结果于2020年9月9日在线发表在Science期刊上,论文标题为“De n
PLoS Pathog:COVID19患者抗体反应有助于疫苗设计
根据9月10日南京大学医学院的吴超教授发表在《PLOS Pathogens》杂志上的一项研究,对COVID-19患者的抗体反应进行的全面分析可以为有效疫苗的开发提供信息。结果表明,康复患者抗体的中和活性在出院后一个月内急剧下降。
G-四链体/hemin脱氧核酶结构设计和催化活性提升研究获进展
G-四链体是由一段或几段富G序列通过分子内或分子间Hoogsteen氢键连接成具有四股核苷酸链的DNA二级结构,特定的阳离子(K+、Na+、NH4+等)位于结构中心进一步稳定结构。相对于双链DNA来说,G-四链体结构具有离子依赖性,并根据富G序列的不同特点呈现出不同的结构形态,因此为许多生物有机小分子提供不同的识别位点。这些小分子配体不仅可以识别特定构型的G