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Nature:董欣年/项耶子揭示动态调控翻译起始的新元件

该团队结合了高分辨率的翻译组学和结构组学技术,首次揭示了植物免疫过程中,mRNA的结构变化动态调节了翻译起始密码子的选择,由此促进抗病相关的mRNA翻译效率提高,增强了植物的抗病性。

2023-09-08

研究揭示哺乳动物生命起始时期的脂代谢重塑

该研究描绘了小鼠和人早期胚胎脂质全景图,为探讨哺乳动物植入前胚胎发育中内源性脂质的重塑提供了资源,并为脂质不饱和度调节胚胎发育和植入提供了机制上的新见解。

2024-02-23

Nature子刊:将Transformer模型应用于蛋白翻译过程

Riboformer提供了解析核糖体分布变化的有力工具,展示了面向上下文的深度学习模型捕捉生物过程复杂动态的潜力。

2024-03-10

Nature Communications:CNOT3是白血病翻译控制的关键调控因子

本研究证明了CNOT3介导的高水平翻译效率对于维持促生长和促生存基因在白血病发生过程中的表达至关重要。

2024-03-20

胰腺导管腺癌剪接改变:具有翻译潜力的新分子景观

胰腺导管腺癌(PDAC)是胰腺最常见和最具侵袭性的肿瘤类型(80%)。PDAC死亡率是世界上所有癌症中最高的之一,在欧洲和北美甚至更高。它占所有癌症相关死亡人数的4.7%,几乎与新病例的数量相当。

2023-12-20

Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Science:揭示CRISPR-Cas抗病毒防御系统抑制mRNA翻译机制

在一项新的研究中,来自立陶宛维尔纽斯大学的研究人员利用生物信息学分析以及生化和结构研究,描述了一个名为Cami1的新型效应蛋白家族的特征。他们发现当称为噬菌体的细菌病毒攻击细菌时,CRISPR-Cas

2023-12-27

Nat cell Biol | 浙江大学张进等团队合作报道哺乳动物生命起始时期的脂代谢重塑图景

本研究为哺乳动物着床前胚胎发育中内源性脂质组的重塑提供了宝贵的资源,并为脂质不饱和对胚胎发生和着床的调节提供了机制见解。

2024-02-04

Cell子刊:北大肿瘤医院揭示食管上皮癌化起始新阶段

该研究基于独特的社区人群内镜筛查专病队列所采集的不同级别病变食管黏膜样本,联合基因组学和长期纵向随访数据,首次揭示在ND-LUL阶段在突变、拷贝数变异及克隆扩增等维度已发生大量基因组变异累积且远期癌变

2023-11-03

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27