Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
Nature Biotechnology:突破mRNA翻译瓶颈:LEGO技术显著提升疫苗和蛋白质疗法的效能
本研究在更大的化学空间上探索了mRNA 5′和3′以及环状RNA化学修饰和拓扑结构改造,大幅提高了mRNA在细胞与小鼠体内的蛋白生产能力,为mRNA翻译起始机制及相关化学修饰设计提供了新见解。
Nature:新研究从结构上揭示一种超级蛋白复合物如何将mRNA翻译和降解关联在一起
这项新的研究提供了直观的证据,表明核糖体、SKI 复合物和外切体这三种蛋白复合物都能像单个机器部件一样直接组合在一起。
Front Med:特殊蛋白YTHDF1或能通过增强AXL的翻译从而促进机体心脏纤维化进展
本文研究为阐明心脏纤维化背后的分子机制提供了重要见解,并识别出YTHDF1或能作为这一过程的关键调节子,通过增强AXL的翻译,YTHDF1就能促进心脏纤维化的激活以及随后心脏纤维化的发展。
研究揭示蛋白质翻译调控衰老新机制
该研究揭示了m7G修饰调控衰老进程这一新的生理功能,发现了新的引起衰老相关的蛋白稳态失衡的上游信号途径。上述成果为健康衰老的干预策略提供了新的可能途径。
Mol Cancer:环状RNA hsa_circ_0000467通过促进eif4a3介导的c-Myc翻译促进结直肠癌的进展
本研究发现circ467可以通过结合eIF4A3提高c-Myc的蛋白翻译效率,从而促进CRC的恶性进展,该工作为CRC的进展机制和CRC治疗的潜在治疗靶点提供了新的见解。
Nature:我国科学家揭示脊椎动物旁着丝粒异染色质起始的保守机制
这项新的研究揭示了组成性旁着丝粒异染色质的从头建立机制,并解释了为什么脊椎动物中明显非保守的旁着丝粒异染色质序列仍然具有相同的组蛋白H3K9me3修饰。
Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。