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Science:利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构

美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下,利用巧妙的新型机器学习技术,开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是,即使只从少数已知结构中学习,他们的方法仍然成功,这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。

2021-08-28

Auris宣布开发抗癌RNAi疗法,核心技术是肝外寡核苷酸递送

  Auris Medical宣布将利用OligoPhore寡核苷酸递送平台开发RNAi疗法,用于治疗KRAS突变驱动的结直肠癌。OligoPhore是Auris 6月3日收购的Trasir Therapeutics(收购后更名为Altamira Therapeutics)的代表技术。递送技术一直被视为释放疗法潜力的关键所在,目前主流的两

2021-07-13

Science:利用RNA-SPLIT技术揭示Xist RNA的动态变化

2021年6月24日讯/生物谷BIOON/---哺乳动物中的X染色体失活(XCI)使得XX雌性相对于XY雄性的X连锁基因表达水平相等。XCI过程由非编码RNA Xist(X 染色体失活特异性转录物)控制,它在需要失活的X染色体中表达,在那里顺式积累并招募基于染色质的基因沉默所需的因子。顺式限制在单个染色体区域的分子基础尚不清楚,但人们认为这涉及特定的Xist

2021-06-24

Nature Communications:RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础

  RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结

2021-06-28

环形RNA数据挖掘新技术研究获进展

  中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队在Nature Biotechnology上发表了题为Comprehensive profiling of circular RNAs with nanopore sequencing and CIRI-long的论文,研究内容为高效测定环形RNA全长转录本的实验和计算方法。该研究主要是利用

2021-03-19

揭示利用新开发的ExSeq测序技术高分辨率确定RNA在细胞中的位置

2021年1月29日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术,设计了一种方法,对组织样本中的信使RNA(mRNA)分子进行标记,然后对mRNA进行测序。相关研究结果发表在2021年1月29日的Science期刊上,论文标题为“Expansion sequencing: Spatially

2021-01-29

Immunity:新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据

从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术,大大提高了从每个细胞收集的信息量。

2020-10-15

Sci Rep:科学家成功利用人工RNA编辑技术修复基因组遗传代码 有望治疗多种遗传性疾病

2020年10月24日 讯 /生物谷BIOON/ --目前并没有确定的疗法来治疗由点突变引起的多种遗传性疾病,近日,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自日本先进科学技术研究所等机构的科学家们通过利用人工的RNA编辑研究了一种治疗手段在治疗遗传性疾病上的可行性和有效性。尽管基因编辑技术作为一种基因修复技术备受关注,但诸如C

2020-10-24

Genome Med:单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法

2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性,这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源:CC0 Public Domain文章中,研究人员利用一种名为单细胞

2020-10-11

Science子刊:开发出一种检测新冠病毒RNA的双色RT-LAMP技术

2020年9月28日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。基于此,人类面临着一项重大的公共卫生挑战。快速检测现有的SARS-CoV-2感染和评估病毒传播至关重要。基于逆转录环介导等温扩增(reverse transcription loop-mediated isother

2020-09-28