Science子刊：开发出一种检测新冠病毒RNA的双色RT-LAMP技术
来源：本站原创 2020-09-28 06:51
2020年9月28日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。基于此，人类面临着一项重大的公共卫生挑战。快速检测现有的SARS-CoV-2感染和评估病毒传播至关重要。基于逆转录环介导等温扩增（reverse transcription loop-mediated isother
2020年9月28日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。基于此，人类面临着一项重大的公共卫生挑战。快速检测现有的SARS-CoV-2感染和评估病毒传播至关重要。
基于逆转录环介导等温扩增（reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP）检测病毒RNA的方法有潜力成为简单、可扩展和广泛适用的检测方法。与基于逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）的方法相比，RT-LAMP检测需要在恒温下孵育，因此无需复杂的仪器设备。
在一项新的研究中，来自德国感染研究中心、德国癌症研究中心和海德堡大学的研究人员使用了一组针对SARS-CoV-2 N基因的引物测试了用于检测SARS-CoV-2病毒RNA的双色RT-LAMP检测方案。相关研究结果近期发表在Science Translational Medicine期刊上，论文标题为“A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples”。
这些作者从正在接受COVID-19测试的个体的768份咽拭子样本中获取多余的RNA样本，并对这些样本进行RT-LAMP检测。他们测定了利用RT-LAMP检测SARS-CoV-2病毒RNA的灵敏度和特异性。
与使用一组高灵敏的引物的RT-qPCR检测方法相比，这些作者发现RT-LAMP检测方法能可靠地检测RT-qPCR测试时循环阈值（Ct）不超过30的SARS-CoV-2 RNA，灵敏度为97.5%，特异性为99.7%。
这些作者还开发了一种不需要事先进行RNA分离步骤的咽拭子直接RT-LAMP（swab–to–RT-LAMP）检测方法，它保留了优良的特异性（99.5%），但比RT-LAMP检测的灵敏度低（对RT-qPCR测试时Ct<30的咽拭子样本而言，灵敏度为86%）。此外，这些作者开发了一种多重测序方法（LAMP-sequencing, LAMP测序）作为诊断验证程序，以检测和记录RT-LAMP反应的结果。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
Viet Loan Dao Thi et al. A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples. Science Translational Medicine, 2020, doi:10.1126/scitranslmed.abc7075.
基于逆转录环介导等温扩增（reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP）检测病毒RNA的方法有潜力成为简单、可扩展和广泛适用的检测方法。与基于逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）的方法相比，RT-LAMP检测需要在恒温下孵育，因此无需复杂的仪器设备。
在一项新的研究中，来自德国感染研究中心、德国癌症研究中心和海德堡大学的研究人员使用了一组针对SARS-CoV-2 N基因的引物测试了用于检测SARS-CoV-2病毒RNA的双色RT-LAMP检测方案。相关研究结果近期发表在Science Translational Medicine期刊上，论文标题为“A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples”。
图片来自Science Translational Medicine, 2020, doi:10.1126/scitranslmed.abc7075。
这些作者从正在接受COVID-19测试的个体的768份咽拭子样本中获取多余的RNA样本，并对这些样本进行RT-LAMP检测。他们测定了利用RT-LAMP检测SARS-CoV-2病毒RNA的灵敏度和特异性。
与使用一组高灵敏的引物的RT-qPCR检测方法相比，这些作者发现RT-LAMP检测方法能可靠地检测RT-qPCR测试时循环阈值（Ct）不超过30的SARS-CoV-2 RNA，灵敏度为97.5%，特异性为99.7%。
这些作者还开发了一种不需要事先进行RNA分离步骤的咽拭子直接RT-LAMP（swab–to–RT-LAMP）检测方法，它保留了优良的特异性（99.5%），但比RT-LAMP检测的灵敏度低（对RT-qPCR测试时Ct<30的咽拭子样本而言，灵敏度为86%）。此外，这些作者开发了一种多重测序方法（LAMP-sequencing, LAMP测序）作为诊断验证程序，以检测和记录RT-LAMP反应的结果。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
Viet Loan Dao Thi et al. A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples. Science Translational Medicine, 2020, doi:10.1126/scitranslmed.abc7075.
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