Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
揭示FANCD2-FANCI识别单链-双链 DNA交叉点并启动DNA修复机制
这项新的研究表明因DNA交联而停滞的复制叉内的DNA 结构(而不是交联 DNA 本身)触发了D2-I复合物停止滑动并夹紧DNA以启动修复。
2024-08-12
Nature:DNA甲基化控制星形胶质细胞的干性
这项研究揭示了星形胶质细胞和神经干细胞虽然具有相似的转录组,但是具有不同的DNA甲基化组,并且DNA甲基化可以调控星形胶质细胞的干性,为将来再生医学提供新的理论依据。
2024-10-09
Nature Metabolism:ASS1通过代谢调节p53介导的DNA损伤反应,在DNA损伤中扮演关键角色
实验结果表明,ASS1是一个代谢检查点,在DNA损伤后,它通过限制核苷酸合成和p53相关基因转录来阻断细胞周期进程,从而实现基因组的维持和存活。
2024-07-29
Cell Metabol:揭示调节机体致病突变遗传背后的特殊DNA机制
本文研究结果表明,线粒体DNA 6mA在真核生物中高度保守,且能通过在体内影响mtDNA的拷贝数、表达和遗传突变水平来调节机体的寿命。
2024-09-11
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。
2024-06-12