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清华大学陈春来/刘俊杰团队揭示CasX靶标搜索和切割过程的动态调控机制

CasX独特的NTSB结构域在DNA解旋和R-loop形成中发挥了重要功能。这一动态模型深化了我们对CasX工作机制的理解,并为CasX以及其他Cas蛋白的优化和改造提出了新的思路和策略。

2024-07-15

Nat Genet:颉伟/王海峰等报道小鼠胚胎失活X染色体高级结构从头建立过程及其调控机制

研究人员利用课题组开发的高灵敏sisHi-C技术,系统分析了从1-细胞胚胎到E9.5胚外组织以及E13.5胚胎细胞的X染色体三维结构,涵盖了X染色体印记失活和随机失活的建立和维持过程。

2024-09-15

Mol Cell | 陈萍/李伟合作揭示FACT介导macroH2A清除机制及其在巨噬细胞功能调控中的作用

该研究全面揭示了组蛋白变体macroH2A通过S139关键位点调控分子伴侣FACT核小体维持功能的分子机制,并探讨这一机制在基因转录激活及巨噬细胞功能活化过程中的作用。

2024-08-12

Cancer Cell:中山大学孙颖团队等实现利用血浆EB病毒DNA实时监测鼻咽癌疗效和预后

研究共前瞻性收集了1000例接受根治性放化疗的鼻咽癌患者治疗过程中12个时间点的外周血(图1),首次完整地绘制了诱导化疗以及放疗过程中cfEBV DNA的动态变化图谱。

2024-08-01

Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点

DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。

2024-10-16

Front Med:对DNA损伤修复基因进行表观遗传学沉默或能揭示一种胰腺癌疗法的潜在标志物

研究结果表明,AZD0156的表观遗传化沉默或能作为预测胰腺癌治疗中患者对ATM抑制剂产生反应的特殊生物标志物。

2024-11-23

Nat Cancer|癌细胞胞外囊泡分泌的DNA竟能阻止肿瘤扩散到肝脏

这项研究不仅加深了我们对癌症进展的理解,也为未来的癌症治疗带来了新的希望。

2024-12-26

Nature:癌症或是由不可逆的DNA突变与表观遗传改变引起

本文研究结果表明,在没有驱动突变存在的情况下,Polycomb蛋白的不可逆剔除会诱导癌症发生,这或许就表明,肿瘤会通过表观遗传学失调而出现,从而引起了所改变的细胞命运的遗传。

2024-06-07

PNAS丨谭蔚泓、韩达合作解密sgc8c DNA适体的复杂三维结构和功能优化

研究结果揭示了sgc8c DNA适体形成精密复杂的三通结构,它能巧妙地从不同区域招募十余个核苷酸汇聚于三通中心构成其“结构-功能”的关键位点,这些信息有效地指导了适体的功能优化。

2024-07-28

Cell:四川大学贾大/苏昭铭团队揭示囊泡运输精准调控新机制

该研究阐明了WDR11复合物的高分辨率结构及功能,并发现对蛋白货物的选择可以发生在囊泡运输的后期,以进一步提高运输保真度。

2024-07-20