Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物学格局!深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。
2025-02-01
单细胞与空间多组学前沿:探索从转录调控到蛋白网络的生命奥秘
2025-08-21
Nature:邓彦翔/周畹町团队将空间多组学技术扩展至DNA甲基化领域
该研究首次开发出一种新型 DNA 甲基化空间多组学技术——Spatial-DMT。该技术可在同一组织切片上同时绘制 DNA 甲基化和基因表达的空间图谱,并达到近单细胞分辨率。
2025-09-07
Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位
该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。
2025-02-26
Nat Commun:空间多组学“破译密码”!新型人工智能算法TACIT有望加速癌症诊断和疗法决策
来自弗吉尼亚联邦大学等机构的科学家们开发了一种名为TACIT的创新技术,其有望为空间多组学领域带来革命性的突破。
2025-06-27
Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录组平台
Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。
2025-08-26
中国学者一作Nature论文:绘制转移性胰腺癌转录组可塑性空间图谱
不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式,即使在同一器官内部,也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外,癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性,而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。
2025-04-27
Nature Methods:当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像,预测细胞级空间转录组
iSCALE 的诞生,为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论,彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。
2025-09-18
我国学者首次在中国空间站发现微生物新物种,其已进化出适应极端太空环境的能力
该研究基于表型、生理生化特征以及基因组注释,表明发现于中国空间站的菌株 JL1B1071T 是尼尔菌属中的一个新物种,并建议命名为天宫尼尔菌(Niallia tiangongensis)新物种。
2025-05-19