生态毒理蛋白质组学是从整体的蛋白质水平上，探讨生物在污染物下，细胞蛋白质谱的变化，并阐明污染物的毒性作用及其机制。“

美国系统生物学研究所（ISB）和AB SCIEX公司签署了一项多年合作协议，共同开发用于蛋白质组学研究的质谱分析方法与技术，其目的旨在重新定义生物标记研究，并通过全面综合的定量蛋白质组学分析技术完善基因组学，这将有助于推动新型医疗护理方法的开发。

生物过程非常复杂，需要利用到各种高科技技术，也就是称为“omics（组学）”的技术工具，这些方法能进行细胞中成千上万个分子的整体分析，并且追踪它们在疾病中作用。 在后基因组时代，研究人员发现细胞整体蛋白，也就是蛋白质组学研究需要提到到一个新的层面，由于蛋白是基因的分子执行者，因此如果我们希望能更全面了解细胞的工作机制，就需要找到这个最找到的拼图。

著名的四大转录因子：Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc对iPSC的形成至关重要，但转录因子激发iPSC形成的步骤及机制一直尚不明确。近期Cell和Cell Report陆续发表了三项新研究成果，分别解析了iPS细胞如何一步步形成的步骤，以及在重编程的第一天和最后三天里的一个两步复位方法，这揭开了iPSCs形成的谜底，也指出了相应提高重编程效率的一些新基因。

糖尿病肾病（DN）是一种逐渐进展的肾脏疾病，由长期高血糖引起的糖尿病的重要并发症。在西方国家，糖尿病肾病是透析的最常见原因。早期发现糖尿病肾病或许能运用药物进行干预治疗，从而延迟或避免使用肾脏替代治疗。

岛津全球应用技术开发中心赵宁伟研究团队在蛋白质组学的研究上取得了新进展。他们描述了一种新的融合免疫沉淀，蛋白电泳，纳升液相和液质离子阱飞行时间质谱用于分析小鼠烧伤模型血清中β-Catenin protein complex的研究策略。结果发现了有显著差异表达的3种伴侣蛋白。

2012年9月26日 讯 /生物谷BIOON/ --来自美国北卡罗来纳州立大学的研究人员开发出一种新技术来鉴定细胞分泌的蛋白。这种新方法应当有助于研究人员在细胞生物学上收集精确的数据。 在这项新研究中，研究人员开发出的这种新方法是基于一个事实：每个细胞利用它的分泌途径来包裹它的蛋白。每个细胞合成蛋白，然后通过这种途径运输它：将它包裹在袋状的膜中，最终将它运输到胞外。

2012 年 9 月 13 日，加利福尼亚州圣克拉拉市和英属哥伦比亚温哥华--安捷伦科技公司宣布与 MRM Proteomics 公司达成合作营销协议。MRM Proteomics 公司是面向制药、生物技术和诊断行业提供先进的蛋白质定量分析、生物标记物和蛋白质组学服务的领先供应商。该项协议将使得双方能够为蛋白质组学领域提供更加完善的解决方案，包括试剂盒、硬件和软件。

2012年9月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，来自圣母大学艾克研究所的研究者开发出了一种新型方法可以直接检测细菌分泌蛋白，这或许为治疗包括肺结核在内的许多疾病提供了新的思路和方法。相关研究成果刊登在了国际杂志Molecular and Cellular Proteomics上。 研究者Champions指出，细菌可以使用多种分泌系统来通过细胞膜转运蛋白质，从而于外界环境进行相互作用。