Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
生物间的奇妙合作——内共生!Nature:通过在真菌中注入细菌诱导新的内共生
注入大肠杆菌后,小孢根霉(真菌)和大肠杆菌(细菌)都在继续生长,而且后者最终迅速生长,以至于小孢根霉对大肠杆菌产生了免疫反应。
2024-10-23
Biophys J:卵巢癌在坚硬的胶原基质上表现出不同的迁移策略
为了解决局限性,作者创建了一个更易于使用的软件工具包,将香农熵(Shannon entropy, 一种捕捉随机性的数学概念)与以前使用的基于运动和形状的测量方法相结合。
2024-11-28
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
不同的神经回路调节着迷幻药的抗焦虑和幻觉效应
在这项研究中,作者给小鼠模型注射了迷幻剂 2,5-二甲氧基-4-碘苯丙胺。他们发现,在服药六小时后,小鼠仍然表现出弹珠掩埋减少和在高架加迷宫中增加探索开放臂的时间。然而,与幻觉相关的头部抽搐却消失了。
2024-11-20
Nature:不同的信号通路或能作为人类上皮癌发生的关键驱动因素
本文研究结果阐明了在哺乳动物组织中应用体内单细胞CRISPR筛选的强大能力,并揭示了肿瘤进化过程中不同的TNF程序,强调了理解上皮细胞克隆扩增和肿瘤发生之间关联的重要性。
2024-07-22
一种新的急性髓系白血病患者接受异基因造血干细胞移植的预后评分系统与现实世界的验证
本研究回顾性分析了336例接受同种异体造血干细胞移植的AML患者的临床记录,并建立了基于OS独立因素的预后系统。
2024-09-28
解锁帕金森病的新治疗靶点!Nat Commun:蛋白质基因组网络分析揭示帕金森病的失调机制和潜在的介质
通过整合UkB蛋白质基因组数据,本研究创建了一个网络模型,以描绘基因组-蛋白质组的关系及其相互作用。
2024-08-31
年轻人的灵丹妙药,老年人的毒药?复旦大学发现,二甲双胍会缩短老年线虫的寿命
为了探究二甲双胍对寿命的影响,研究人员给年轻线虫和老年线虫施加多个浓度的二甲双胍。结果发现,二甲双胍治疗使年轻线虫的平均寿命延长了11.1%,但老虫线虫的寿命缩短了22.2%。
2024-07-22