Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理
通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。
2024-09-26
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。
2024-06-12
Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析
本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。
2024-06-20
Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Theranostics:单细胞分析揭示了肝细胞癌中PD-1阻断反应相关的免疫特征
研究表明免疫TMEs在肝癌患者中表现出反应性、无反应性和未治疗的差异,这些差异可能解释了免疫治疗在一些肝癌患者中的低疗效,研究发现这些细胞和分子具有独特的功能,可以靶向增强肝癌患者的免疫治疗效果。
2024-07-26
单细胞RNA测序,揭示不同血管化策略对大脑类器官的影响
血管化的大脑类器官不太可能发生细胞死亡,因此被认为是未来大脑研究的标准。这项研究对于未来血管化类器官的制造至关重要,有望开发出更高保真的血管化类器官。
2023-12-22
Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法
结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。
2024-10-02
Nature Methods | GPT-4在单细胞分析中的突破:高效的细胞类型识别
该研究不仅证实了GPT-4在生物医学领域的应用潜力,同时也为单细胞RNA测序分析中的细胞类型标注提供了一种新的、高效的解决方案。
2024-04-06