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Nature Methods:如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

随着单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)等技术的引入,研究人员得以从单个细胞的角度揭开胚胎发育的秘密,描绘出生命起始的动态蓝图。

2024-11-24

Nature Methods : 如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

研究人员借助干细胞技术构建了胚胎模型(stem cell-based embryo models),用于模拟人类胚胎的发育。

2024-12-09

Nat Cell Biol:单细胞RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理

通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。

2024-09-26

Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点

DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。

2024-10-16

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。

2024-06-12

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

Theranostics:单细胞分析揭示了肝细胞癌中PD-1阻断反应相关的免疫特征

研究表明免疫TMEs在肝癌患者中表现出反应性、无反应性和未治疗的差异,这些差异可能解释了免疫治疗在一些肝癌患者中的低疗效,研究发现这些细胞和分子具有独特的功能,可以靶向增强肝癌患者的免疫治疗效果。

2024-07-26

Nat Method:单细胞分辨率下对细胞信号交流进行分析的多实例学习模型-Spacia

Spacia模型能够帮助研究者从各种生物学样品的单细胞空间转录组数据中获得新的知识。

2024-09-06

Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法

结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。

2024-10-02

Nature Aging:单细胞RNA测序揭示卵巢衰老的具体机制

总的来说,该研究提供了促进慢性卵巢炎症和纤维化随年龄增长的潜在机制的见解,并为该领域提供了重要的资源。

2024-01-18