Mol Cell:整合子或能作为人类转录组的“守护者”
2021年1月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自奥胡斯大学等机构的科学家们通过研究揭示了一种特殊的细胞特性,其或能保护机体细胞免于基因表达的有毒副产物的影响。这种活性对于多细胞有机体维持一个强大的基因产物进化“库”的能力而言非常重要。制造过程需要质量控制系统来确保功能性产品的适当组装,
Nature:科学家成功绘制出肠道微生物组的空间复杂图谱 有望帮助改善人类健康研究
2020年12月5日 讯 /生物谷BIOON/ --人类机体肠道中有哪些微生物?这些微生物具体都在哪里?近日,一篇刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自康奈尔大学等机构的科学家们通过研究开发了一种成像工具来绘制出成百上千种不同微生物菌群所在位置及其身份的复杂空间图谱,比如组成肠道微生物组的微生物菌群等,这种新型工具未来或将帮助科学家们理解复杂微生物群
成功绘制出关键5hmC生物标志物的全基因组图谱 有望改善人类癌症的诊断
2020年12月5日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自芝加哥大学等机构的科学家们通过研究绘制出了一张涵盖多种人类组织类型的全基因组5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)图谱,该图谱揭示了5hmC作为能检测多种严重人类疾病(比如癌症和多种慢性疾病)的通用型生物标志物的强大性能。与基因抑制
万种鸟类基因组计划第二阶段研究结果发表
11月12日,中国科学院昆明动物研究所研究员张国捷及其团队,联合深圳华大生命科学研究院、丹麦哥本哈根大学等多家单位,在Nature上以封面形式同期发表了两篇文章,报道了万种鸟类基因组计划第二阶段(科级别)的研究结果。该研究团队发表了363种鸟类基因组数据,同时通过这一数据建立了无参考序列下多基因组比对和分析的新方法,并基于这一新方法阐明高密度物种
全球微生物模式基因组测序计划取得重要进展
10月29日,《核酸研究》(Nucleic AcidsResearch)在线发表了国家微生物科学数据中心(中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心)团队关于全球模式微生物基因组数据库gcType的文章。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。模式菌株(type strains)是在给微生物定名、分类记载和发表
纳米孔PromethION测序+Shasta完成人类基因组端粒到着丝粒的高效从头组装
Shasta是一个用于纳米孔测序数据的从头组装和矫正算法,由加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)和陈-扎克伯格倡议计划(CZI)联合开发。团队在2019年利用初代Shasta分析流程对纳米孔测序数据进行从头组装、矫正和Hi-C拼接Scaffold(图1),使用一台纳米孔PromethION测序设备在9天内完成了11个人类基因组测序,研究成果发表在《N
非洲病原体基因组计划正式启动,获Illumina、Oxford Nanopore等多家机构投资
近日,非洲疾病控制与预防中心及非洲联盟委员会联合启动了一项病原体基因组计划(Pathogen Genomics Initiative , PGI),旨在通过配备工具、培训和数据基础设施的跨大陆综合实验室网络,充分利用关键的基因组测序技术,增强病原体疾病监测和公共卫生合作。目前,这项为期四年的测序项目已获得高达1亿美元的资金支持,资金来源包括比尔和
Nat Med:科学家成功利用宏基因组测序技术快速识别人类体液中的病原体
2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究发现,利用宏基因组测序技术(metagenomic sequencing)或能快速检测人类体液样本中的病原体,文章中,研究人员描述了他们如何对多种人群开展宏基因组测序检测,其中大部分人群都是因病
Nature:继2003年和2011年后 美国国家人类基因组研究所再发布人类基因组研究领域美好新愿景!
2020年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自美国国家人类基因组研究所(NHGRI)等机构的科学家们发表了他们在基因组前言研究领域改善人类健康的战略愿景,这一愿景描述了未来十年人类基因组学研究中最引人注目的研究重点和研究机遇,这标志着这一研究领域或有望进入一个新的研究时代。研究者Eric Gree
Science:新研究详细揭示人类正常心脏和衰竭心脏中的代谢组学特征
2020年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国宾夕法尼亚大学、普林斯顿大学和费城儿童医院的研究人员提供了人类心脏使用燃料和营养物的详细情况。这项研究是同类研究中的第一次,它对数十名人类参与者的循环系统不同部位的血液进行同步采样,以记录流进和流出跳动的心脏的相关分子的水平。由此产生的数据揭示了正常心脏以及衰竭心脏中燃料使用的关键特