师从诺奖得主David Baker，西湖大学陈子博发表Science论文，开发基于蛋白质的人工神经网络
该研究证明了利用合成蛋白在哺乳动物细胞中构建模拟人工神经网络的回路来进行复杂信号分类的可行性。
2024-12-24
Nat Commun ：哺乳动物活细胞内可编程重构RNA调控网络的人工基因线路
研究团队首次将原本不可检测的单点突变RNA感应由1.5倍提升至94倍。由此，成功实现单碱基突变的检测，也将RNA表达量的感应扩展至序列变化的感应，极大地丰富了RNA-IN模块的识别范围。
2024-11-02
Science：利用人工智能设计隐秘剪接，治疗渐冻症等神经退行性疾病
该研究开发了一种针对肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞痴呆症（FTD）的精准医学方法——TDP-REG，利用细胞中TDP-43功能丧失（TDP-LOF）时发生的隐秘剪接事件，以在病变细胞中特异性表达。
2024-10-07
Alzheimers Dement：基于网络的分析揭示了阿尔茨海默病中引起神经炎症的小胶质细胞如何形成
该团队在阿尔茨海默病患者的小胶质细胞培养皿实验中验证了他们的计算预测，他们在实验中表明酮咯酸阻断了一种称为I型干扰素（IFN）信号传导的免疫过程。
2024-12-27
Nature：揭示果蝇机体神经元网络将简单命令转化为复杂行为背后的分子机制
研究结果表明，命令样的DNs并不会单独行动，而是会招募额外的DNs网络，从而就为揭示简单的大脑命令如何产生协调行动提供新的见解。
2024-06-09
Nature子刊：乔燕/林艺扬团队在构建人工细胞有序网络领域取得进展
近日，乔燕课题组联合北京化工大学教授林艺扬教授、英国布里斯托大学 Stephen Mann 教授，在 Nature 子刊 Nature Chemistry 上发表了题为：Superstructural
2023-11-13
研究人员构建深度神经网络模型解密磷酸化位点的功能景观
NADP+/NADPH（辅酶Ⅱ）参与磷酸戊糖代谢过程，为大分子生物合成和清除过量ROS提供还原力，支持细胞生长和存活，对快速增殖的癌细胞尤为重要。
2023-09-07
多层级的图神经网络推动蛋白质功能预测的发展
高通量测序的进展推动了蛋白质序列数量的快速增长。尽管如此，由于实验研究需要较长的周期并且费用昂贵，大部分蛋白质序列缺乏功能注释。因此，具备自动而准确推断蛋白质功能的计算方法变得至关重要。
2023-08-17