从实验到分析——深度解析基于二代测序的LncRNA研究及应用
非编码RNA起初被认为是基因组转录的“垃圾”,而近年来,多个高水平的杂志以封面形式报道长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)的重要性,由此LncRNAs引起了人们广泛的关注,已成为各研究领域的一颗新星。
本次讲座主要将从以下几个方面展开:
①LncRNA的方案设计及研究思路
②LncRNA的实验及分析流程
③LncRNA的案例解析
④LncRNA+mRNA+miRNA联合分析方案解析
⑤一类特殊的ncRNA——circular RNA
许争峰:二代测序技术在单基因疾病诊断中的应用
介绍了二代测序技术的一些优点,应用于临床诊断及医学研究。介绍了自己实验室采用的单基因病诊断策略,以及主要的研究方向。还介绍了1.遗传代谢病基因诊断panel设计,包括遗传代谢病panel简况及总结;提到了MMA的遗传学基础;基因型分析策略。2.显性多囊肾基因诊断方案设计,包括ADPKD的临床表现;遗传学基础;PKD1基因检测的传统方法和新方法探索。提到DNDDE 遗传学基础,基因诊断实践指南。
赵奇志:高精确度、高灵敏性的循环肿瘤DNA测序,助力癌症精准分子医疗
本讲座包括了DNA突变到肿瘤,基于精准分子医疗-基于肿瘤基因突变信息,液态活检,循环肿瘤DNA(ctDNA),可在各种癌症中检测到,循环肿瘤DNA(ctDNA)以及时间敏感的检测需求。CtDNA液态活检的优势;难点。提到AccuraGen核心技术。Nebula-无偏差扩增。常规NGS测序会产生较高的背景噪声,Firefly去除测序错误噪声。CfDNA ddPCR和NGS突变检测的相符性,CtDNA技术在肿瘤诊疗上的应用,不同的panel以适用不同的需要。
黄岩谊:微流控技术与单细胞测序
介绍了精准医学的功能核心,通过生物信息学大数据挖掘来指导癌症临床研究,通过测序来确定个性化药物治疗,介绍了一些基因测序的例子,通过癌症组学信息来指导治疗。通过分子信息来预测病人,制定治疗决策。
单分子测序开启转录组学研究新时代
以基因测序技术发展为背景,阐述以第三代测序技术为核心的全长转录组测序与二代测序技术的转录组测序的差异,以及在研究基因结构等问题上所带来的巨大优势。并以经典案例为参考,阐述全长转录组测序在样品制备、实验设计及数据分析等环节的切入点和注意事项。
任鲁风:从测序技术的研发层面对我国基因测序全产业链营造的设想
主要内容1.走马观花-测序技术发展及趋势。2.值2000万的经验-测序技术细节层面剖析。3.百废待兴-测序技术自主研发的基础条件。4.全产业链-新的基因测序产业中下游概念。5.群策群力-基因测序技术与产业联盟建设的宗旨。
邓杏飞:RNA高通量测序的最新进展和应用
主要有1.RNA-seq简介(NGS和RNA-seq、RNA-seq主要应用和最新进展)2.RNA-seq主要临床应用和挑战。3.最新进展-直接RNA测序(单分子基因测序)4.广东国盛医学科技有限公司简介。
文路: 循环游离DNA甲基化组测序新技术及其在肿瘤早期诊断中的应用
介绍了cpG岛异常甲基化与人类肿瘤,循环游离DNA,循环游离DNA甲基化组学检测的技术挑战性,提到传统DNA甲基化组技术无法用于ccfDNA检测,介绍了甲基化CpG短串联扩增与测序技术等。
薛正晟:基于下一代测序技术的人体微生态精准监测与健康管理
介绍了微生物组相关内容,人体微生态,人体微生态组研究,人体微生态检测和健康管理:“量身定制”关键生物标记关联分析。提到了基于高通量测序的人体微生态检测,检测主要策略。提到了DNA测序“进化史”及一些测序平台等。