Hi-c技术在微生物中的应用
Hi-C是高通量染色体构象捕获（High-throughput Chromosome Conformation Capture, Hi-C）技术的简称，是由美国Job Dekker研究团队于2009年开发，最初用于捕获全基因组范围内所有的染色质内和染色质之间的空间互作信息，经过近几年的飞速发展，现已应用于基因表达的空间调控机制研究、构建染色体水平参考基因组、构建单体型图谱等方向。在后基因组时代，基因组学研究已全面进入3D时代。
RNAscope原位杂交技术对复杂组织进行空间表达分析
RNAscope和BaseScope原位杂交（ISH）广泛应用于人类样本库和临床科研以及临床前动物模型等组织中的高分辨率目标RNA表达分析。ACD的RNA-ISH检测在临床实验研究中是有效的，能够在复杂的组织微环境中进行定量的、细胞特异性的表达分析。 RNAscope和相关ISH技术的应用进展包括： - 固定组织中RNA的单分子检测 - 空间、多重RNA-ISH用于RNAseq转录组学的验证 - SARS-CoV-2及其他病毒病原体检测 - 实体瘤组织中CAR-T细胞的检测 - AAV基因治疗的生物分布
CUT&RUN技术的成功指南
与染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测一样，核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN) 是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA 相互作用的强大通用技术 (1-4)。这种测定法可用于检测与基因组某个特定区域有关的多种蛋白，或相反，用于检测与某种特殊蛋白有关的基因组的多个区域。此外，CUT&RUN 测定法可用于明确某种特殊蛋白-DNA 相互作用的空间和时间关系。例如，CUT&RUN 检测可用于确定各种蛋白因子被募集到某个基因启动子上的特定顺序，或用于“测定”基因激活期间整个基因位点上某种特殊组蛋白修饰的相对量。除了组蛋白，CUT&RUN 测定法还可用于分析转录因子和辅因子结合、DNA 复制因子和 DNA 修复蛋白的结合。 CUT&RUN 提供了一种检测细胞中蛋白-DNA 相互作用的快速、可靠且真正的低细胞数测定法。与 ChIP 实验不同，CUT&RUN 不存在甲醛交联、染色质碎裂和免疫沉淀，使之成为一种使蛋白-DNA 相互作用富集和检测靶基因的更快且更有效的方法。CUT&RUN 可在一天之内完成从活细胞到纯化 DNA 的过程，且经证明每次检测只需使用少至 500-1000 个细胞 (1,2)。和 ChIP 中碎裂所有细胞染色质不同，CUT&RUN 利用一种染色质抗体靶向消化方法，从而使背景信号比 ChIP 实验低得多。因此，CUT&RUN 仅需 ChIP-seq 检测所需测序深度的 1/10 (1,2)。最后，加入简单的Spike-in DNA 即可准确定量和标准化靶标蛋白结合，而这是 ChIP 方法无法实现的。这种方法可有效标准化样品间和实验间的信号。 我将讨论CUT&RUN的基本原理，以及在设计实验时需要考虑的重要因素。此外，我还将介绍Cell Signaling Technology（CST）的CUT&RUN Assay Kit（#86652）和CUT&RUN pAG-MNase酶，相关数据显示它能适用于多种细胞类型的组蛋白修饰，转录因子和转录辅助因子的研究。 参考文献 1.Skene, P.J. and Henikoff, S. (2017) Elife 6, pii: e21856. doi: 10.7554/eLife.21856. 2.Skene, P.J. et al. (2018) Nat Protoc 13, 1006-19. 3.Meers, M.P. et al. (2019) Elife 8, pii: e46314. doi: 10.7554/eLife.46314. 4.Meers, M.P. et al. (2019) Mol Cell 75, 562-575.e5. 研讨会PPT下载链接：http://learn.cst-c.com.cn/zh-cn/ppt-download-cut-run
显微活体成像技术的开发和应用
生命科学研究的进步离不开生物成像技术的发展，虽然生物成像领域的各种显微成像技术和共聚焦技术在图像的清晰度、分辨率等方面都取得了极大的进展。但对于细胞在动物体上如何实现运动、增殖或与周围细胞的相互作用的研究一直是生命科学研究领域的迫切要解决的问题。在此背景下，显微活体成像技术应用而生。该技术能够实现将分子生物学技术从体外研究转移到动物体内研究，直接监控活体生物体内的细胞活动和基因行为，尤其是可以直接观测活体动物体内肿瘤的生长及转移，感染性疾病发展过程、特定基因的表达等生物学过程，并且其凭借检测灵敏度高，操作简单等优势，现已经广泛应用于肿瘤学、药物研究、细胞标记、基因表达与基因功能的研究、细胞凋亡等研究领域。 鉴于显微活体成像技术多方面的发展潜力和广阔的应用前景，生物谷携手全球显微镜与科学仪器的知名品牌徕卡共同举办本次讲坛，希望通过本次讲坛能够充分与从事显微活体成像技术开发和应用研究领域的专家进行交流，达成多方面的合作，共同促进显微活体成像技术的发展。
超高分辨率荧光显微技术前沿与生物学应用
超高分辨率荧光显微成像可以说是近二十年来新兴的一项革命性技术，此前光学显微镜的分辨率只能达到200纳米，被称为阿贝衍射极限，而通常病毒和亚细胞结构的尺寸只有几十到200多纳米。超高分辨显微技术的诞生突破了这个极限，使得显微成像分辨率进入振奋人心的纳米级别时代，对于精细结构的研究得到了强力的技术支持。目前商业化比较常见的超高分辨荧光显微技术主要包括受激发射耗损显微术（STED）、随机光学重构显微术（STORM）、光激活定位显微术（PALM）、结构化照明显微术（SIM）等，基于这些技术开发的显微产品在细胞生物学、神经生物学、病毒学、植物学、病理学、遗传学、医学等领域都得到了逐步应用。 生物谷联合全球显微科技与分析科学仪器领导品牌徕卡显微系统，推出超高分辨率荧光显微成像空中讲坛，关注成像领域前沿技术进展的同时，也将聚焦此技术在生物学、医学领域的具体应用及取得的研究成果，以此推动超高分辨成像技术的广泛、高效使用，以及技术的持续更新发展。
3D类器官药物筛选新技术
药物筛选是新药研发过程中最重要的步骤之一，活细胞因其与生理内环境、微型化和高通量等特点常被用作筛选工具。进入21世纪以来，随着药物筛选技术的发展和精准医疗时代的到来，相对于传统细胞培养，类器官因具有更接近生理细胞组成和行为、更稳定的基因组、更适合于生物转染和高通量筛选等优势，作为最佳的药物筛选模型脱颖而出。 此外，3D类器官模型还可以进行临床前药物筛选来评价药物疗效和安全性、进行多种肿瘤药物和放疗剂量的筛查等，通过建立每一个病人的化疗和放疗敏感性档案，为肿瘤个性化治疗提供数据支撑和指导等。但目前基于3D类器官的研究在疾病模型重建、药物筛选、新药研发等领域还存在诸多挑战。 在此背景下，生物谷携手生命科学领域领先品牌Thermo Fisher ，邀请从事3D类器官药物筛选技术研究领域的专家分享当下类器官药物筛选技术研究的最新研究进展，促进类器官在交叉学科间的交流，加快类器官研究的临床转化应用。
精准优治，技术先行——感染性疾病临床精准检测
分子检测技术在病原学诊断上的发展非常迅速，疫情防控过程中更是在病原微生物溯源、检测上发挥了极大作用，基础研究和临床应用都备受关注。在感染性疾病领域，精准、快速的病原学诊断是不可或缺的，与实验室研究有所区别，临床检测中更要求敏感度高、结果准确
纳米孔测序技术在检测罕见病相关结构变异中的应用
罕见病大多数是遗传性疾病，全球大约有3.5亿人患有罕见病，其发病率低，种类繁多且表型复杂多样，导致临床上难以进行及时和准确的诊断。 结构变异(SVs)是基因组变异的主要原因，包括插入、缺失、重复、倒位和易位，从癌症到神经病学以及罕见病的发病机制，人类基因组学中结构变异的重要性已在许多领域中日益凸显。纳米孔长读长测序具有超长读长（目前最长为4Mb），无GC偏好性，实时分析，快速，可便携，直接检测甲基化等优势，能够跨越重复序列从而克服短读长测序在鉴定罕见病SVs中所面临的挑战。
多维度成像方案与 CRISPR-Cas9 技术结合助力药学研究
多维度成像方案与 CRISPR-Cas9 技术结合助力药学研究 简介：CRISPR-Cas9系统是一种适应性免疫系统，可作为操纵基因组序列的快速、高效、低成本且可扩展的工具。该系统可对活细胞中重复或低重复序列基因位点进行实时多位点同步成像..
【另辟蹊径 探微索隐】- 新一代脂质组学创新技术研讨会
脂质组学已成为生物医学研究的热点之一，采用质谱技术进行脂质组学研究，已能解决诸如脂质的种类鉴别及脂链组成等问题。但是，脂质精细结构，如C=C及sn-位置等，对大规模组学来说仍是一个难点。近年来，区别与定量脂质C=C位置异构体已被证明对于生理过程研究、疾病标志物筛查及新药研发有着重要意义。 2021年6月29日，沃特世将联合清谱科技举行【另辟蹊径 探微索隐 - 新一代脂质组学创新技术研讨会】，发布脂质组学精细结构分析的全新解决方案。该解决方案基于Waters ACQUITY UPLC系列超高效液相色谱、Xevo G2-XS QTof高分辨质谱，以及清谱科技(PURSPEC) Ω Analyzer脂质分析系统，具备自动化的仪器控制、批量样本运行和全流程数据处理分析功能，支持包括碳碳双键(C=C)位置精准定位在内的脂质多维结构解析，为实现脂质组学的大幅跨越和发展相关生物医学研究及疾病标志物筛查提供新维度，迎来脂质组学高通量及深维度的大数据时代。诚邀您的参加，并与相关专家深入交流。