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Simultaneous quantification of 47 gene expression in FFPE samples by a novel Pcr-free approach

基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differential gene expression)指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5%~10%。

2015-03-05 课时:17分钟

田亚平:新的肿瘤血液生物标志:microRNA

MicroRNA(miRNA)是一类生物体内长度约22个左右核苷酸的小RNA,相关研究显示其广泛存在于多种体液中,且可稳定存在较长时间。miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用,一个miRNA可以调节多个靶基因的表达,而几个miRNAs也可同时调节一个基因。

恶性肿瘤的发生发展过程非常复杂,常常涉及多个基因的表达异常,因此miRNA复杂调节网络的紊乱与细胞增殖和凋亡过程的调节失控可能存在一定关联。

为此我们利用芯片和 Solexa 测序技术筛选肿瘤相关miRNA,在血液中发现了一些与原发性肝癌、宫颈癌、肺癌等密切相关的miRNA,经Q-Pcr方法临床验证,初步证明其具有一定辅助诊断价值,进一步研究可为恶性肿瘤的生物靶向治疗提供新的线索与靶点。

2015-05-06 课时:11分钟

陈扬超:以微核糖核酸(microRNA)为靶的抗癌药物研发

非编码微RNA(microRNA)可通过调节众多基因的表达来行使致癌或是抑癌功能,调节microRNA表达变化的小分子化合物被视为潜在的抗肿瘤药物。最近,在欧洲以微RNA(microRNA-122)为靶的化合物作为抗丙肝病毒感染药物已经进入临床二期试验,标志着以非编码微RNA为靶的药物研发进入了一个新的时期。

非编码微RNA-34a(miR-34a)是一个肿瘤抑制基因,在包括肝癌在内的众多肿瘤中表达下调或是沉默。因此,miR-34a是一个很有前途的癌症治疗靶标。我们成功构建了一个miR-34a的荧光报告系统,通过该系统,我们从化合物文库中筛选出激活miR-34a表达的小分子化合物3。

化合物3可以特异激活肝癌细胞内miR-34a的表达及降低miR-34a目的基因的表达。 体内外试验证明化合物3具有明显的抗癌活性。比较化合物3与肝癌晚期用药Sorafenib显示化合物3具有更加显著的抗癌活性并且没有毒性。MiR-34a小分子调控剂作为潜在的新抗癌药物前景令人向望。

2015-05-15 课时:41分钟

MicroRNA研究的综合解决方案

对于microRNA的研究,已进行了十多年。基因芯片和新一代测序等高通量技术有力地推动了microRNA的研究。李明辉博士在视频中先介绍了microRNA的背景,概括了microRNA研究的基本问题和研究方法。然后结合上海伯豪的服务内容,详细介绍了microRNA研究的微阵列芯片和新一代测序方法,并辅以上海伯豪的多个具体技术服务案例进行详细说明。视频还对microRNA的验证和功能研究方法进行了阐述。最后,结合实际案例,视频还介绍了如何将microRNA作为生物标志物进行研究。

2015-07-09 课时:46分钟

数字Pcr-陈巍学基因(17)

数字微滴Pcr(ddPcr)是一种新形的绝对定量Pcr,其特点是灵敏度高、定量精确、检测的线性范围宽、特异性好、费用适中,是一种很有前途的分子定量检测手段。
本视频以Bio-Rad公司的数字微滴Pcr为例,介绍了此项技术。

2015-07-13 课时:11分钟

贾立军:Neddylation蛋白修饰-crL 泛素连接酶通路调控肿瘤细胞自噬应答的机制与潜在应用

贾立军博士,复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所研究员和博士生导师。目前主要从事“针对蛋白质翻译后修饰通路进行抗肿瘤分子靶点发现”等研究工作。

相关研究在 J Natl Cancer Inst(JNCI)、Cancer Research、Clinical Cancer Research、Autophagy、Cell Death & Differentiation、Cell Death & Disease、Int J Cancer和J Biol Chem等学术期刊发表文章40篇、获邀参编英文专著4部。主持国家自然科学基金(81372196,31071204,30500637,81172092)、国家重大科学研究计划(2012CB910302,课题负责)、上海市卫生局A类重点项目 (2010012)、上海市“浦江人才 ”资助计划(12PJ1400600)和上海高校特聘教授(东方学者)资助计划等科研项目。

学术兼职包括:国家自然科学基金委员会医学科学领域学科评审组专家、中华医学科技奖评审委员会委员、上海市免疫学会肿瘤免疫专业委员会委员、高等学校自然科学奖和技术发明奖评审专家和十余种学术期刊审稿专家。荣获上海高校特聘教授(东方学者)和上海市浦江人才等荣誉称号。

2015-09-09 课时:40分钟

上海伯豪lncrNA芯片服务

上海伯豪针对广大客户的需求,开发出全新的lncrNA芯片,并利用Agilent公司专利的SurePrint技术制造。为您提供完善的基因芯片技术服务,并完成数据分析,提供完整的实验报告。

SBC-lncrNA芯片技术特点:
1)芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;
2)覆盖主流数据库几乎所有lncrNA和mRNA,可同时检测lncrNA和mRNA,并挖掘两者之间的关联;
3)随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncrNA,
同时,上海伯豪利用Affymetrix开发的GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0 (HTA2.0)芯片,为客户提供常规mRNA以及超过40,000个非编码转录本的表达检测服务,也是研究lncrNA非常合适的技术手段。

2015-10-14 课时:7分钟

上海伯豪lncrNA测序服务

转录组是特定物种、组织或细胞类型转录的所有RNA(转录本)的集合,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA, 非编码RNA又包括:tRNA,rRNA,snoRNA,microRNA,piRNA,lncrNA等。通过比较转录组或基因表达谱的研究以揭示生物学现象或疾病发生的分子机制是高通量组学研究的一个常用策略。利用高通量测序技术研究转录组在全面快速得到基因表达谱变化的同时,还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的cSNP(编码序列单核苷酸多态性)、可变剪接等序列及结构变异,另外对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有其独特的优势。

转录组测序具有以下优势
1. 直接得到核酸序列信息,除了得到基因表达量的差异,更可以检测RNA的结构和结构变异。
2. 开放性的转录组分析:无需参考基因组信息,无需设计探针,不但能检测已知基因还能够发现新的转录本。
3. 在测序覆盖率足够大时能够检测到细胞中的低丰度转录本。
4. 随着测序深度的增加可以获得更广的动态检测范围,能够同时鉴定和定量高丰度转录本和低丰度转录本。

上海伯豪推出基于Illumina测序平台的全转录组测序服务,可同时检测样本中mRNA和lncrNA的表达,伯豪公司完善的实验管理体系和数据分析流程,为您研究lncrNA提供全套解决方案。

2015-10-14 课时:8分钟

LncrNA研究综合解决方案

lncrNA研究是目前RNA研究中最活跃的方向之一。在本视频中,俞伟平博士介绍了lncrNA的发现、起源、特点、分类以及有关的数据库,并结合研究案例介绍了lncrNA的功能以及lncrNA相关研究的活跃领域。俞博士还结合上海伯豪lncrNA相关产品及服务,全面系统地介绍了通过基因芯片和新一代测序等高通量手段对lncrNA进行发现、分析、验证和功能探索的方法。

2015-11-17 课时:59分钟

Pcr:聚合酶链式反应

聚合酶链式反应,或称Pcr,是一种通过热循环反应来扩增DNA的技术,热循环是指在固定的时间间隔内温度变化的循环。采用热稳定的DNA聚合酶,Pcr可以用DNA的合成原料,脱氧核苷三磷酸合成大量的DNA拷贝。Pcr反应包括三步,变性,退火,和延伸。变性是Pcr循环的第一步,它将DNA碱基之间的氢键打开来熔解DNA双链而产生单链DNA。退火则是将温度降到足够低,使寡聚核苷酸引物能够结合到DNA模板上。在延伸过程中,DNA聚合酶将合成新的双链DNA。

本短片将介绍Pcr的过程。除了逐步讲述如何准备一个常用的Pcr反应,还将描述Pcr的基本原理。视频展示了一个Pcr反应的所需组分,以及引物设计的规则,并给出了保证Pcr反应成功的一些有用技巧。

2015-12-23 课时:14分钟