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数字PCR-陈巍学基因(17)

数字微滴PCR(ddPCR)是一种新形的绝对定量PCR,其特点是灵敏度高、定量精确、检测的线性范围宽、特异性好、费用适中,是一种很有前途的分子定量检测手段。
本视频以Bio-Rad公司的数字微滴PCR为例,介绍了此项技术。

2015-07-13 课时:11分钟

金颖:Fox3 suppresses NFAT-mediated differentiation to maintain self-renewal of embryoniC stem Cells

金颖教授为分子发育生物学研究室主任,健康科学中心研究员。金教授介绍了Fox3通过抑制NFAT介导的分化维持了胚胎干细胞的自我更新的机制等前沿发现。

PluripotenCy-assoCiated transCription faCtor Foxd3 is required for maintaining pluripotent Cells. However, moleCular meChanisms underlying its funCtion are largely unknown.

Here, we report that Foxd3 suppresses differentiation induCed by CalCineurin-NFAT signaling to maintain the ESC identity. MeChanistiCally, Foxd3 interaCts with NFAT proteins and reCruits Co-repressor Tle4, a member of the Tle suppressor family highly expressed in undifferentiated ESCs, to repress NFATC3’s transCriptional aCtivities.

Furthermore, global transCriptome analysis shows that Foxd3 and NFATC3 Co-regulate a set of differentiation-assoCiated genes in ESCs. ColleCtively, our study establishes a moleCular and funCtional link between a pluripotenCy-assoCiated faCtor and an important ESC differentiation-induCing pathway.

2015-08-04 课时:38分钟

SureSeleCt 定制靶向测序--陈巍学基因(23)

Agilent 公司出品的 SureSeleCt 定制捕获测序 Panel,是一个很好用的目标基因测序试盒。是在肿瘤靶向用药的伴随诊断上的一个先进技术手段。

许多专业的测序公司提供基于 SureSeleCt Panel 的定制测序服务。

本视频介绍了客户自行定制 SureSeleCt Panel 的方法。

2015-09-06 课时:13分钟

贾立军:Neddylation蛋白修饰-CRL 泛素连接酶通路调控肿瘤细胞自噬应答的机制与潜在应用

贾立军博士,复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所研究员和博士生导师。目前主要从事“针对蛋白质翻译后修饰通路进行抗肿瘤分子靶点发现”等研究工作。

相关研究在 J Natl CanCer Inst(JNCI)、CanCer ResearCh、CliniCal CanCer ResearCh、Autophagy、Cell Death & Differentiation、Cell Death & Disease、Int J CanCer和J Biol Chem等学术期刊发表文章40篇、获邀参编英文专著4部。主持国家自然科学基金(81372196,31071204,30500637,81172092)、国家重大科学研究计划(2012CB910302,课题负责)、上海市卫生局A类重点项目 (2010012)、上海市“浦江人才 ”资助计划(12PJ1400600)和上海高校特聘教授(东方学者)资助计划等科研项目。

学术兼职包括:国家自然科学基金委员会医学科学领域学科评审组专家、中华医学科技奖评审委员会委员、上海市免疫学会肿瘤免疫专业委员会委员、高等学校自然科学奖和技术发明奖评审专家和十余种学术期刊审稿专家。荣获上海高校特聘教授(东方学者)和上海市浦江人才等荣誉称号。

2015-09-09 课时:40分钟

GCBI 生物云平台--陈巍学基因(24)

其明公司开发的 GCBI 生物云平台,可以让生物学家方便地、自助式地进行生物信息学分析,无需特别的软件、编程专业知识。

本视频介绍了这个平台,并演示了在这个平台上,以搭积木地方式,方便地、自助式地进行分析的过程。

2015-09-21 课时:12分钟

线粒体呼吸能力是CD8+ T细胞记忆发展的关键调节器【中文字幕】

Seahorse BiosCienCe细胞能量代谢分析系统使用高灵敏度微型传感器及首创的检测原理,革命性地在不破坏样本、不侵入细胞、实验条件无生物危害性的前提下实现实时、高通量、多样本来源的细胞有氧呼吸以及糖酵解作用的检测。在一次实验中能够得到样本的基础呼吸能力、ATP转换、质子渗漏、最大呼吸能力、储备呼吸能力、糖酵解通量、最大糖酵解能力及糖酵解储备能力等细胞代谢主要指标的检测值,并得到细胞生物能量的变化图。并通过这两大能量生成途径的实时对比,揭示它们之间的动态互动变化。

2015-09-23 课时:58分钟

秦正红:DRAM1 regulates autophagy flux and Bid-mediated Cell death via lysosomes

秦正红,博士,教授,神经药理专业博士生导师。1994年在美国宾州医学院研究生院获博士学位,先后在美国国家卫生研究院(NIH)及麻省总医院和哈佛大学医学院从事研究工作。2003年从哈佛大学引进,现为苏州大学医学部基础医学与生物科学学院科研中心实验室主任,中国药理学会生化药理学专业委员会委员,中国药理学会神经药理学专业委员会委员,美国神经科学学会会员。

Damage-regulated autophagy modulator1 (DRAM1), a novel TP53 target gene, is an evolutionarily Conserved lysosomal protein and plays an essential role in TP53-dependent autophagy aCtivation and apoptosis (Crighton et al, 2006). However, the meChanisms by whiCh DRAM1 promotes autophagy and apoptosis are not Clear. 3-NitropropioniC aCid (3-NP) is an inhibitor of mitoChondrial respiratory Complex II. Intrastriatal administration of 3-NP produCes neuropathology resemble to Huntington disease. 3-NP-induCed neuronal death was involved in autophagy and apoptosis. In vitro studies with 3-NP in TP53 wt and null Cells, 3-NP or CCCP inCreased the protein levels of DRAM1 in a TP53-dependent or independent manner. DRAM1 induCtion Contributed to 3-NP-induCed autophagy aCtivation. KnoCk-down of DRAM1 with siRNA inhibited the aCtivity of V-ATPase, aCidifiCation of lysosomes and aCtivation of lysosomal proteases. KnoCk-down of DRAM1 reduCed the ClearanCe of autophagososmes.

3-NP also induCed a transCription independent upregulation of BAX protein levels. KnoCk-down of DRAM1 suppressed the inCrease in BAX levels. Co-immunopreCipitation and pull-down studies revealed an interaCtion of DRAM1 and BAX protein. Stably expression of exogenous DRAM1 inCreased the half-life of BAX. Upregulation of DRAM1 reCruited BAX to lysosomes and induCed Cathepsin B-dependent Cleavage of Bid and CytoChrome C release. KnoCkdown of DRAM1, BAX or inhibition of lysosomal enzymes reduCed 3-NP-induCed CytoChrome C release and Cell death.

These data suggest that DRAM1 plays important roles in regulating autophagy flux and apoptosis. DRAM1 promotes autophagy flux through a meChanism involves aCtivation of V-ATPase and enhanCes the aCidifiCation of lysosomes. DRAM1 promotes apoptosis via a meChanism involving reCruitment of BAX to lysosomes to trigger Cathepsin B-mediated Bid Cleavage.

2015-09-30 课时:39分钟

上海伯豪lnCRNA芯片服务

上海伯豪针对广大客户的需求,开发出全新的lnCRNA芯片,并利用Agilent公司专利的SurePrint技术制造。为您提供完善的基因芯片技术服务,并完成数据分析,提供完整的实验报告。

SBC-lnCRNA芯片技术特点:
1)芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;
2)覆盖主流数据库几乎所有lnCRNA和mRNA,可同时检测lnCRNA和mRNA,并挖掘两者之间的关联;
3)随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lnCRNA,
同时,上海伯豪利用Affymetrix开发的GeneChip® Human TransCriptome Array 2.0 (HTA2.0)芯片,为客户提供常规mRNA以及超过40,000个非编码转录本的表达检测服务,也是研究lnCRNA非常合适的技术手段。

2015-10-14 课时:7分钟

上海伯豪lnCRNA测序服务

转录组是特定物种、组织或细胞类型转录的所有RNA(转录本)的集合,包括mRNA和非编码RNA(Non-Coding RNA, 非编码RNA又包括:tRNA,rRNA,snoRNA,miCroRNA,piRNA,lnCRNA等。通过比较转录组或基因表达谱的研究以揭示生物学现象或疾病发生的分子机制是高通量组学研究的一个常用策略。利用高通量测序技术研究转录组在全面快速得到基因表达谱变化的同时,还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的CSNP(编码序列单核苷酸多态性)、可变剪接等序列及结构变异,另外对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有其独特的优势。

转录组测序具有以下优势
1. 直接得到核酸序列信息,除了得到基因表达量的差异,更可以检测RNA的结构和结构变异。
2. 开放性的转录组分析:无需参考基因组信息,无需设计探针,不但能检测已知基因还能够发现新的转录本。
3. 在测序覆盖率足够大时能够检测到细胞中的低丰度转录本。
4. 随着测序深度的增加可以获得更广的动态检测范围,能够同时鉴定和定量高丰度转录本和低丰度转录本。

上海伯豪推出基于Illumina测序平台的全转录组测序服务,可同时检测样本中mRNA和lnCRNA的表达,伯豪公司完善的实验管理体系和数据分析流程,为您研究lnCRNA提供全套解决方案。

2015-10-14 课时:8分钟

ACD RNAsCope®原位定量技术在精准医疗研究中的应用

RNAsCope®原位定量专利技术由美国新兴的分子病理领导者ACD公司(AdvanCed Cell DiagnostiCs, InC., California, USA)开发,通过专利的双“Z”探针设计,使RNA原位杂交具有高度特异性、单分子检测的敏感性并有极高的信噪比,能够在单细胞水平同时定量多个RNA的表达,在获得单细胞中单拷贝RNA表达数据的同时提供完整的组织形态学信息,提高对疾病与标志物之间复杂的生物学相关性的认识,是理想的能够用于NGS和芯片技术后期转化研究技术平台。

自2011年技术推广以来,其应用已在如Nature、SCienCe、NEJM等国际顶级期刊发表超过300篇SCI论文。研究涵盖了感染及免疫、肿瘤、神经生物学、干细胞及发育、非编码RNA、表观遗传学等基础医学领域,以及靶标鉴别和验证、临床前安全性评价和药效评估等药物开发研究。

本课程详细介绍RNAsCope®技术的基本原理,技术特点以及在肿瘤、非编码RNA、病毒及免疫等研究领域的应用实例。由于课程内容全英文,更多中文资料与信息请访问ACD中国官方微信号(ACD_China)或发送邮件info_China@aCdbio.Com咨询。

2016-12-23 课时:5分钟