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BIO Integra:单细胞RNA测序分析揭示了不同的人类自身免疫性疾病中免疫细胞的异质性

来自中国中山大学等机构的科学家们通过研究成功整合了五种不同的自身免疫性疾病中的外周血细胞的scRNA-seq数据。

2023-09-25

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

Nat Biotechnol | 北京大学伊成器等团队合作开发同时对5mC和5hmC进行单细胞分析的新方法

该研究提出SIMPLE-seq(通过测序同时分析表观遗传胞嘧啶修饰),用于在单细胞和单碱基分辨率下联合分析5mC和5hmC。

2024-02-14

EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制

果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细

2023-08-24

Nat Methods | 单细胞三维基因组与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17

刘琦/王平/何雅億团队提出AI计算解决方案,利用单细胞组学驱动泛癌肿瘤个体化组合用药

comboSC创新性的提出了一种单细胞组学驱动的泛癌种肿瘤个体化组合用药的计算框架和解决方案,在单细胞组学驱动的精准医学领域进行了有益的探索,其可行性和有效性经过了Proof-of-Concept验证

2023-12-06

Cell:世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱发布

该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据,为后续的相关研究提供了重要的数据资源库,现已实现公开共享。 

2023-07-14

Nature:新研究在单细胞分辨率下绘制出人类肠道的空间图谱

当你想到自己理想中的社区时,也许你会想到绿树成荫的街道,或者一个紧密团结、互相帮助的社区。你很可能不会想到你的消化系统。

2023-07-25

研究人员开发出基于单分子测序平台的scNanoHi-C技术,可精准检测单细胞高阶染色质互作

真核生物基因的表达受到基因组中顺式作用元件的复杂调控。哺乳动物基因组中存在大量的顺式作用元件,例如:启动子、增强子、沉默子、绝缘子等等,其数量远远超过蛋白编码基因。

2023-09-18

单细胞精度揭示苔藓类植物地钱的成熟和衰老轨迹

苔藓植物是植物界最原始的类群之一,它们生长在湿润和阴暗的环境中,没有根、茎和叶等器官,也不能通过维管束进行水分和养分的输送。尽管苔藓植物在进化上具有重要性,并且拥有相对简单的植株构造,但是人们对于其细

2023-06-17