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液体活检成功检测MSI和TMB 它们能够预测对免疫疗法的反应么?

靶向PD-1/PD-L1的癌症免疫疗法已经成为多种癌症的标准疗法。但只有约20%-30%的患者对免疫检查点抑制剂有反应,如果在患者用药之前就可以通过生物标志物来识别合适的患者,那么对临床医生和患者的决定都将起到重要的帮助。于本月发表在Clinical CancerResearch期刊上的一篇文章显示,一项液体活检可以检测微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)

2019-09-13

研究通过多任务深度神经网络建立药物调控激酶谱的预测分析方法

蛋白激酶(protein kinases)是细胞功能的关键调节分子,是生物体内最大且功能最多样的基因家族之一。因此,激酶是开发治疗癌症、炎症、糖尿病、心血管疾病和阿尔兹海默症等相关疾病药物的重要靶标。然而,由于激酶家族蛋白质(特别是催化域)结构的高度保守性,给高效选择性激酶抑制剂的开发带来了巨大挑战。二十一世纪以来,随着计算机计算能力的迅猛提升和大数据的涌现,深度学习在机器学习算法的基础上快速崛起

2019-09-08

皮肤神经竟然可以预测和对抗感染

2019年8月20日讯 /生物谷BIOON /——掐自己一下,如果你感到疼痛,那是因为皮肤上有特殊的神经末梢。匹兹堡大学医学院(University of Pittsburgh School of Medicine)的研究人员有一项令人惊讶的发现,他们发现痛觉神经还有助于对抗皮肤感染并防止其传播,这表明了一种新型的免疫系统。这项基于小鼠实验的发现于近日发表在《Cell》杂志上。"这些痛觉神经可以检

2019-08-20

Nature:利用人工智能预测急性肾损伤

2019年8月12日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,美国和英国的研究人员将人工智能(AI)应用于解决检测住院患者急性肾损伤(acute kidney injury, AKI)的问题。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“A clinically applicable approach to continuous prediction of future acute k

2019-08-12

Nat Biotechnol:研究人员开发新的机器学习模型预测CRISPR-Cas9编辑人原代T细胞的结果

2019年8月4日讯 /生物谷BIOON /——在一项近日发表在《Nature Biotechnology》上、题为"Large dataset enables prediction of repair after CRISPR-Cas9 editing in primary T cells"研究中,来自Chan-Zuckerberg Biohub、斯坦福大学、加州大学等单位的研究人员在Alexa

2019-08-04

研究发现“上”收缩压和“下”舒张压分别预测了心脏病发作或中风的风险

2019年7月23日讯 /生物谷BIOON /——一项研究发表在《新英格兰医学杂志》上的研究结果与之前几十年的研究结果相反:血压读数中的"上"收缩压和"下"舒张压分别预测了心脏病发作或中风的风险。此前的研究表明,高收缩压比舒张压更有可能导致不良结果。"这项研究为一个基本问题提供了大量的数据,并且给出了如此清晰的答案,"首席作者Alexander C. Flint博士说,他是凯萨医疗机构中风专家和研

2019-07-23

Nat Immunol:新型血液检测手段或能帮助预测乳腺癌患者的疾病复发风险

2019年7月14日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Nature Immunology上的研究报告中,来自美国希望之城综合癌症研究中心的科学家们通过研究开发了一种特殊的血液检测手段,其或有望帮助预测新诊断的乳腺癌患者是否会在几年后疾病复发。图片来源:CC0 Public Domain医学博士Peter P. Lee指出,这项研究中我们首次将实体瘤与血液生物标志物相联系,生物

2019-07-14

组织浸润淋巴细胞特征预测早期/中期肝癌患者的生存

肝细胞肝癌(简称肝癌)是一种常见的恶性肿瘤,全球范围内年死亡患者超过约70000例。其临床预后不仅与肿瘤自身和潜在肝脏疾病有关,同时与肿瘤异质性也密切相关。目前,针对肝癌患者的预后评估,依赖于肿瘤个数、直径、血管侵犯和淋巴结转移等传统指标。研究指出,肝癌是一种异质性极高的肿瘤。处于同一肿瘤分期的肝癌患者,其临床预后可能不尽相同。因此,如何从肿瘤微环境探寻新颖的预测指标,将有助于为肝癌患者制定个体化

2019-06-23

研究利用人工智能预测蛋白质“光学指纹”

蛋白质是生命的基石,生物的功能依赖于既稳定而又灵活可变的蛋白质结构。蛋白质的光谱响应信号,尤其是紫外光谱,可以称之为蛋白质骨架的“指纹”。这个“光学指纹”,经过理论模拟的解读,可以揭示出精确的蛋白质结构,为生命科学和医学诊断提供极其重要的信息。然而,蛋白质的结构极其复杂多变,需要做大量的高精度的量子化学理论计算。由于计算量太大,即使是最厉害的超级计算机轻易也“吃不消”。所以蛋白质的光谱的理论解读是

2019-06-16

CytoDyn新分析方法可在2小时内预测对CCR5抗体leronlimab应答的患者

2019年06月19日讯 /生物谷BIOON/ --CytoDyn是一家专注于开发新型人源化CCR5拮抗剂leronlimab(PRO140)用于多种治疗适应症的生物技术公司。近日,该公司宣布其在确保leronlimab治疗效果和安全性方面取得了重大进展,已成功开发出了一种能够可靠地确定HIV患者CCR5状态的分析方法,该分析方法可在2小时内预测leronlimab单药疗法候选HIV患者的应答率以

2019-06-19