Nature：DNA的“俄罗斯套娃”——PADIT-seq揭示了一个颠覆教科书的转录因子结合新模型
研究人员开发了一种创新的高通量技术，不仅以前所未有的灵敏度绘制出了转录因子的完整结合图谱，更重要的是，他们基于这些新发现提出了一个颠覆性的“重叠结合位点”模型。
Cell：沉默的基因组，喧嚣的转录场——解密结核菌适应性的隐藏驱动力
该研究通过技术创新和大规模数据分析，为我们描绘了一幅前所未见的结核菌演化全景图。它告诉我们，面对这个古老而狡猾的对手，我们不能再仅仅满足于研究它“是什么”，而必须更深入地理解它“做什么”以及“如何做”
Nature Biotechnology：皮肤上的“沉默多数派”——元转录组学揭示微生物丰度与活性的惊人背离
研究人员不仅巧妙地克服了在皮肤上施展这一技术的重重困难，更向我们展示了一个与传统认知大相庭径的、充满活力的皮肤微生物世界。
Nature Methods：当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像，预测细胞级空间转录组
iSCALE 的诞生，为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论，彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。
EGFR突变肺腺癌转化型小细胞肺癌研究新突破：转录组分析揭示不同亚组及精准治疗机会
转化型小细胞肺癌（T-SCLC）在分子表征特征方面，既与肺腺癌（LUAD）存在显著差异，亦区别于经典小细胞肺癌（SCLC）的典型分子表型。
Nature子刊：清华大学陈国强团队开发新型正交转录突变系统，蛋白质进化速度提升150万倍
该研究开发的正交转录突变系统具有高突变效率、高特异性和低脱靶率的优点，在实际进化过程中仅用 1 天即可完成以往需要数周才能实现的蛋白质优化过程。
一个被“驯化”的逆转录病毒的自白
研究人员通过一个精巧的体外模型，发现一段在人类基因组中“安家落户”的古老病毒序列，不仅不是“垃圾”，反而是调控人类早期胚胎发育、决定生命能否正常启航的关键“主开关”。
王思远团队开发单分子分辨率、覆盖全基因组的空间转录组学新技术
该研究开发了 RAEFISH，这是一种基于图像的空间转录组学新方法，具有全基因组覆盖范围和完整组织中的单分子分辨率，从而解决了现有空间转录组学技术普遍存在的“鱼与熊掌不可兼得”的困境。
中国学者一作Nature论文：绘制转移性胰腺癌转录组可塑性空间图谱
不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式，即使在同一器官内部，也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外，癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性，而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。
转录组学分析+机器学习再次证实存在成人神经发生
研究者们结合了转录组学数据和机器学习方法，成功识别了青少年和成年人海马中处于增殖阶段的神经前体细胞（NPC）。这是成人也存在神经发生的直接证据。